Los pangolines, amenazados por su dieta especial y alto riesgo de extinción, enfrentan desafíos fisiológicos en cautiverio, como enfermedades digestivas y alteraciones inmunitarias. Este estudio examinó la microbiota intestinal de los pangolines en cautiverio utilizando técnicas metagenómicas para comprender su estructura, función e influencia en la salud del huésped. Los hallazgos clave revelaron que ambas especies albergaban predominantemente Firmicutes, Proteobacteria y Bacteroidetes, donde se observó una mayor diversidad de especies y niveles más bajos de Proteobacteria. Un análisis funcional identificó 45 vías metabólicas cruciales para la digestión de sus dietas especializadas, y se observaron diferencias significativas en los mecanismos de resistencia a antibióticos entre las especies. Este estudio concluyó que los factores ambientales y dietéticos moldearon significativamente la microbiota intestinal, lo que impactó la salud de los pangolines. Estos hallazgos proporcionaron datos valiosos para mejorar el cuidado en cautiverio, las estrategias de conservación, la comprensión de la adaptabilidad ecológica de los pangolines y enfatizar la necesidad de protocolos personalizados de gestión dietética y de salud.