Los ecosistemas de agua dulce están cada vez más amenazados por la degradación del hábitat y otras presiones ambientales. Para evaluar la condición de ríos y arroyos, los científicos a menudo utilizan bioindicadores como los macroinvertebrados acuáticos. Estos organismos pueden ser estudiados utilizando enfoques taxonómicos tradicionales (basados en la composición de taxones) o a través de rasgos funcionales (que describen sus roles ecológicos). En este estudio, analizamos datos de la Cuenca del Río Paute situada en los Andes tropicales de Ecuador para evaluar qué tan bien se alinean entre sí las métricas de diversidad taxonómica y funcional. Nuestros resultados muestran que ciertas métricas funcionales y taxonómicas proporcionan información ecológica similar, mientras que otras divergen. Esto sugiere que combinar ambas perspectivas puede mejorar las evaluaciones de la salud de los ríos. Los hallazgos ofrecen un marco replicable que puede ayudar a mejorar los esfuerzos de biomonitoreo en sistemas de agua dulce tropicales.