España es el principal productor de cítricos en la Unión Europea, con la Cuenca del Río Segura en el sureste de España desempeñando un papel crucial en esta industria. Sin embargo, se ha pasado por alto el impacto de la producción agrícola local en la apropiación del agua. Este estudio evalúa la huella hídrica (HH) tanto de la producción convencional como orgánica de cítricos utilizando el enfoque de la Red de Huella Hídrica, abordando prácticas beneficiosas con el objetivo de reducir el impacto de la apropiación del agua. Enfocándose en cuatro campos de cítricos, la evaluación abarca los componentes verde, azul y gris de la HH, y los impactos secundarios del consumo de electricidad y combustibles fósiles, que generalmente se omiten en las evaluaciones de la HH. Los resultados indican que la HH total para la producción orgánica de naranjas y limones es más de un 19% menor que para el sistema convencional. Se observan diferencias notables en el componente azul, atribuidas al uso de mantillos vegetales, y en el componente gris debido al impacto reducido de los fertilizantes en las prácticas orgánicas. Los valores individuales y totales de la HH son más bajos que los informados en otros estudios de cítricos, y están vinculados a una gestión eficiente de los recursos en regiones semiáridas que ayuda a superar la escasez de agua. Sin embargo, el análisis de sostenibilidad revela importantes desafíos para el sector de cítricos en la cuenca, destacando la presión sobre los recursos dada la limitada disponibilidad de agua. El indicador de agua disponible restante (AWARE) demuestra una privación potencial extremadamente alta de agua en la zona. En general, el estudio subraya la necesidad de integrar análisis de HH en la planificación agrícola para gestionar eficazmente la escasez de recursos. La investigación futura debería centrarse en el desarrollo de metodologías precisas e incorporar prácticas agrícolas no convencionales para mejorar la sostenibilidad. Esta investigación proporciona información valiosa para los interesados que buscan optimizar el uso del agua en la agricultura en condiciones de escasez de recursos.