Antecedentes: Dado que los jabalíes tienen una inmunidad innata contra la fiebre porcina africana (ASF), es fundamental comprender la novedad evolutiva de los jabalíes para explicar su resistencia específica a la ASF. Métodos: Aquí, presentamos dos genomas nuevos completados de un jabalí y un cerdo doméstico keniano como referencias genómicas fundamentales para elucidar los mecanismos genéticos de la tolerancia a la ASF. Resultados: Variaciones genómicas múltiples, incluyendo pérdidas de genes, contracciones independientes y la expansión de familias de genes específicas, moldearon probablemente el genoma del jabalí para adaptarse al medio ambiente. Es importante destacar que el análisis de la presencia y ausencia de secuencias genómicas reveló que la secuencia de ADN del genoma del jabalí carecía del gen lactato deshidrogenasa B en el cromosoma 2 en comparación con el genoma de referencia. La sobreexpresión y el siRNA de inhibieron la replicación del virus de la fiebre porcina africana. Combinado con datos de secuenciación a gran escala de 42 cerdos en todo el mundo, la contracción y expansión de las familias de genes que contienen motivos tripartitos (TRIM) revelaron que los genes de la familia TRIM en el genoma del jabalí son potencialmente responsables de su tolerancia a la ASF. Conclusión: Nuestros resultados ayudarán a mejorar la comprensión de la resistencia genética a la ASF en los cerdos.