Comparaciones de Secuencias Genómicas entre Fenotipos de Colonias Pequeñas y Grandes de Aislados Clínicos Equinos de
Autores: Ayalew, Lisanework E.; Mekuria, Zelalem H.; Despres, Beatrice; Saab, Matthew E.; Ojha, Shivani
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Comparaciones de Secuencias Genómicas entre Fenotipos de Colonias Pequeñas y Grandes de Aislados Clínicos Equinos de
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Bacteria grampositivos
Tracto reproductivo
Secuenciación del genoma
Morfotipos
Factores de virulencia
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
es una bacteria grampositiva exigente y se aísla ocasionalmente del tracto reproductivo de yeguas aparentemente sanas o de yeguas con anomalías en el tracto reproductivo. Aparte de algunas secuencias de genes 16S rRNA basadas en GenBank y un informe reciente sobre la ensamblaje completo del genoma, no hay datos detallados sobre la secuencia genómica y los datos experimentales clínicos disponibles sobre la bacteria. Recientemente, observamos un aumento inusual en la detección del organismo a partir de muestras asociadas con fallos reproductivos en yeguas en Canadá Atlántico. Se detectaron dos morfotipos de colonia (es decir, pequeño y grande) en medios de cultivo, que fueron identificados por espectrometría de masas MALDI-TOF y secuenciación del gen 16S rRNA. Aquí, informamos sobre la secuenciación del genoma completo y la caracterización de las variantes de morfotipo. La longitud del genoma de los fenotipos grandes estaba entre 2.42 y 2.43, y el fenotipo pequeño era de 1.99 Mbs. La identidad nucleotídica ortóloga entre los fenotipos de colonia grandes era de aproximadamente 99%, y entre los fenotipos de colonia grandes y pequeños estaba entre 77.86 y 78.52%, lo que podría justificar la clasificación de los dos morfotipos en diferentes especies. El análisis filogenético basado en genes 16S rRNA o en genes de mantenimiento concatenados agrupó las variantes de colonia pequeñas y grandes en dos clústeres genotípicos diferentes. La proteína UvrA, que es parte del sistema de reparación por escisión de nucleótidos (NER), y la proteína de subunidad pequeña de la 3-isopropoylmalato deshidratasa expresada por el gen fueron identificadas como posibles factores de virulencia en los morfotipos de colonia grandes y pequeños, respectivamente. Sin embargo, se requerirán estudios funcionales detallados para determinar los roles exactos de estas y otras proteínas hipotéticas identificadas en el metabolismo celular y la potencial patogenicidad en yeguas.
Descripción
es una bacteria grampositiva exigente y se aísla ocasionalmente del tracto reproductivo de yeguas aparentemente sanas o de yeguas con anomalías en el tracto reproductivo. Aparte de algunas secuencias de genes 16S rRNA basadas en GenBank y un informe reciente sobre la ensamblaje completo del genoma, no hay datos detallados sobre la secuencia genómica y los datos experimentales clínicos disponibles sobre la bacteria. Recientemente, observamos un aumento inusual en la detección del organismo a partir de muestras asociadas con fallos reproductivos en yeguas en Canadá Atlántico. Se detectaron dos morfotipos de colonia (es decir, pequeño y grande) en medios de cultivo, que fueron identificados por espectrometría de masas MALDI-TOF y secuenciación del gen 16S rRNA. Aquí, informamos sobre la secuenciación del genoma completo y la caracterización de las variantes de morfotipo. La longitud del genoma de los fenotipos grandes estaba entre 2.42 y 2.43, y el fenotipo pequeño era de 1.99 Mbs. La identidad nucleotídica ortóloga entre los fenotipos de colonia grandes era de aproximadamente 99%, y entre los fenotipos de colonia grandes y pequeños estaba entre 77.86 y 78.52%, lo que podría justificar la clasificación de los dos morfotipos en diferentes especies. El análisis filogenético basado en genes 16S rRNA o en genes de mantenimiento concatenados agrupó las variantes de colonia pequeñas y grandes en dos clústeres genotípicos diferentes. La proteína UvrA, que es parte del sistema de reparación por escisión de nucleótidos (NER), y la proteína de subunidad pequeña de la 3-isopropoylmalato deshidratasa expresada por el gen fueron identificadas como posibles factores de virulencia en los morfotipos de colonia grandes y pequeños, respectivamente. Sin embargo, se requerirán estudios funcionales detallados para determinar los roles exactos de estas y otras proteínas hipotéticas identificadas en el metabolismo celular y la potencial patogenicidad en yeguas.