Análisis comparativo del genoma y del secretoma de cepas: explorando patogenicidad y dinámicas evolutivas
Autores: Villanueva, Oscar; Nguyen, Hai D. T.; Ellouze, Walid
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis comparativo del genoma y del secretoma de cepas: explorando patogenicidad y dinámicas evolutivas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Patógeno oomiceto destructivo
Agricultura global
Familias Solanaceae
Cucurbitaceae
Contenido de efectores
Patogenicidad
Aislados canadienses
Genomas
Análisis comparativo del secretoma
Efectores RxLR
CRN
Perfiles de CAZyme
Paredes celulares vegetales
Infección
Adaptación del hospedador
Estrategias de manejo de enfermedades
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 26
Citaciones: Sin citaciones
es un patógeno oomiceto destructivo que representa una amenaza significativa para la agricultura global al infectar una amplia gama de cultivos económicamente importantes en las familias Solanaceae y Cucurbitaceae. En Canadá, el patógeno ha sido responsable de pérdidas sustanciales en cultivos de invernadero y de campo. A pesar de la extensa investigación mundial sobre , se sabe poco sobre el contenido de efectores y la patogenicidad de los aislamientos canadienses. En este estudio, secuenciamos y analizamos los genomas de dos cepas canadienses, 55330 y 55898, y realizamos un análisis comparativo del secretoma con las cepas de referencia a nivel mundial LT1534 y LT263. Las cepas canadienses mostraron genomas más pequeños de 57,3 Mb y 60,2 Mb en comparación con LT263 con 76 Mb, pero conservaron repertorios diversos de efectores, incluidos efectores RxLR y CRN, y exhibieron un potencial patogénico robusto. Nuestro análisis reveló que, aunque las cepas canadienses tienen menos grupos de efectores únicos en comparación con LT263, poseen perfiles de CAZyme comparables, lo que enfatiza su capacidad para degradar las paredes celulares de las plantas y promover la infección. Las diferencias en el contenido de efectores probablemente reflejan la adaptación al huésped, ya que infecta una variedad de especies vegetales. Este estudio proporciona información valiosa sobre las características genéticas de los aislamientos canadienses y sienta las bases para futuros esfuerzos en el desarrollo de estrategias de manejo de enfermedades dirigidas.
Descripción
es un patógeno oomiceto destructivo que representa una amenaza significativa para la agricultura global al infectar una amplia gama de cultivos económicamente importantes en las familias Solanaceae y Cucurbitaceae. En Canadá, el patógeno ha sido responsable de pérdidas sustanciales en cultivos de invernadero y de campo. A pesar de la extensa investigación mundial sobre , se sabe poco sobre el contenido de efectores y la patogenicidad de los aislamientos canadienses. En este estudio, secuenciamos y analizamos los genomas de dos cepas canadienses, 55330 y 55898, y realizamos un análisis comparativo del secretoma con las cepas de referencia a nivel mundial LT1534 y LT263. Las cepas canadienses mostraron genomas más pequeños de 57,3 Mb y 60,2 Mb en comparación con LT263 con 76 Mb, pero conservaron repertorios diversos de efectores, incluidos efectores RxLR y CRN, y exhibieron un potencial patogénico robusto. Nuestro análisis reveló que, aunque las cepas canadienses tienen menos grupos de efectores únicos en comparación con LT263, poseen perfiles de CAZyme comparables, lo que enfatiza su capacidad para degradar las paredes celulares de las plantas y promover la infección. Las diferencias en el contenido de efectores probablemente reflejan la adaptación al huésped, ya que infecta una variedad de especies vegetales. Este estudio proporciona información valiosa sobre las características genéticas de los aislamientos canadienses y sienta las bases para futuros esfuerzos en el desarrollo de estrategias de manejo de enfermedades dirigidas.