Una Comparación Experimental de Métodos de Selección de Características y Clasificación para Conjuntos de Datos de Microarreglos
Autores: Cilia, Nicole Dalia; De Stefano, Claudio; Fontanella, Francesco; Raimondo, Stefano; Scotto di Freca, Alessandra
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2019
Acceso abierto
Artículo científico
2019
Una Comparación Experimental de Métodos de Selección de Características y Clasificación para Conjuntos de Datos de Microarreglos
Categoría
Gestión y administración
Subcategoría
Gestión de la tecnología y la inovación
Palabras clave
Análisis
Conjuntos de datos de microarreglos de ADN
Investigación del cáncer
Proceso de selección de características
Esquemas de clasificación
Comparación experimental.
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 1
Citaciones: Sin citaciones
En la última década, ha habido un creciente interés científico en el análisis de conjuntos de datos de microarreglos de ADN, que se han utilizado ampliamente en la investigación básica y traslacional del cáncer. Los campos de aplicación incluyen tanto la identificación de sujetos oncológicos, separándolos de los sanos, como la clasificación de diferentes tipos de cáncer. Dado que los experimentos de microarreglos de ADN generan típicamente un número muy grande de características para un número limitado de pacientes, la tarea de clasificación es muy compleja y generalmente requiere la aplicación de un proceso de selección de características para reducir la complejidad del espacio de características e identificar un subconjunto de características distintivas. En este marco, no hay resultados estándar de vanguardia generalmente aceptados por la comunidad científica y, por lo tanto, es difícil decidir qué enfoque utilizar para obtener resultados satisfactorios en el caso general. Basado en estas consideraciones, el objetivo del presente trabajo es proporcionar una amplia comparación experimental para evaluar el efecto del proceso de selección de características aplicado a diferentes esquemas de clasificación. Para fines de comparación, consideramos tanto técnicas de selección de características basadas en ranking como métodos de selección de características de vanguardia. Los experimentos proporcionan una visión general amplia de los resultados obtenibles en conjuntos de datos de microarreglos estándar con diferentes características en términos tanto del número de características como del número de pacientes.
Descripción
En la última década, ha habido un creciente interés científico en el análisis de conjuntos de datos de microarreglos de ADN, que se han utilizado ampliamente en la investigación básica y traslacional del cáncer. Los campos de aplicación incluyen tanto la identificación de sujetos oncológicos, separándolos de los sanos, como la clasificación de diferentes tipos de cáncer. Dado que los experimentos de microarreglos de ADN generan típicamente un número muy grande de características para un número limitado de pacientes, la tarea de clasificación es muy compleja y generalmente requiere la aplicación de un proceso de selección de características para reducir la complejidad del espacio de características e identificar un subconjunto de características distintivas. En este marco, no hay resultados estándar de vanguardia generalmente aceptados por la comunidad científica y, por lo tanto, es difícil decidir qué enfoque utilizar para obtener resultados satisfactorios en el caso general. Basado en estas consideraciones, el objetivo del presente trabajo es proporcionar una amplia comparación experimental para evaluar el efecto del proceso de selección de características aplicado a diferentes esquemas de clasificación. Para fines de comparación, consideramos tanto técnicas de selección de características basadas en ranking como métodos de selección de características de vanguardia. Los experimentos proporcionan una visión general amplia de los resultados obtenibles en conjuntos de datos de microarreglos estándar con diferentes características en términos tanto del número de características como del número de pacientes.