La respuesta al estrés de una planta implica la producción de fitoquímicos, incluidos los compuestos fenólicos. Su síntesis puede ser modulada por sistemas de cultivo orgánicos (ORG) o no orgánicos (NORG) en los que se cultivan. Para examinar este tema, se compararon trece alimentos de origen vegetal cultivados en sistemas ORG y NORG en términos de capacidad antioxidante, contenido total de fenólicos, antocianinas, flavan-3-oles y flavonoides. Los resultados mostraron que las frutas NORG tendían a tener un mayor contenido de compuestos fenólicos, mientras que las frutas ORG tenían más capacidad antioxidante. Las legumbres NORG se destacaron por tener valores más altos en todos los parámetros analizados en comparación con su equivalente ORG. Los frutos secos ORG mostraron más flavan-3-oles y flavonoides que sus contrapartes NORG, sin embargo, tendían a ser menos antioxidantes. Las verduras ORG mostraron más fenólicos y antocianinas, lo que se reflejó en una mayor capacidad antioxidante que las NORG. Estos hallazgos sugieren que los sistemas de cultivo modulan de manera diferencial la composición de compuestos fenólicos y la capacidad antioxidante según la especie de planta estudiada.