La aplicación de fertilizante orgánico afecta a los microbios del suelo y a las actividades enzimáticas. En este estudio, exploramos los efectos de varios tratamientos de fertilización a largo plazo (estiércol, M; fertilizante químico, NP; estiércol + fertilizante químico, MNP; y sin fertilizante, CK) en la estructura de la comunidad bacteriana y en las actividades de sucrasa, ureasa y fosfatasa alcalina del suelo en Shaping, Hequ, China. Se utilizó secuenciación de alto rendimiento para amplificar la tercera a la cuarta región hipervariable del ARN ribosomal 16S para el análisis de la estructura de la comunidad bacteriana. Las actividades enzimáticas se determinaron por colorimetría. El suelo tratado con MNP tuvo el índice de Estimador de Cobertura basado en Abundancia bacteriana más alto y las actividades enzimáticas. Los resultados del análisis de coordenadas principales mostraron diferencias significativas entre los distintos tratamientos de fertilización (<0.001). Proteobacteria, Actinobacteria, Acidobacteria, Gemmatimonadetes y Chloroflexiwere fueron consistentemente dominantes en todas las muestras de suelo. El análisis de redundancia y las pruebas de permutación de Monte Carlo mostraron que las comunidades bacterianas del suelo estaban significativamente correlacionadas con el nitrógeno alcalino-hidrolizable, la materia orgánica, la ureasa y la fosfatasa alcalina. Nuestros resultados revelan los efectos fundamentalmente diferentes que los fertilizantes orgánicos e inorgánicos tienen en las comunidades bacterianas del suelo y sus funciones.