Dinámica temporal del transcriptoma revela el mecanismo de las diferencias en el desarrollo muscular y la deposición de IMF entre cabras Fuqing y cabras Nubias
Autores: Liu, Yuan; Wu, Xianfeng; Xu, Qian; Lan, Xianyong; Li, Wenyang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Dinámica temporal del transcriptoma revela el mecanismo de las diferencias en el desarrollo muscular y la deposición de IMF entre cabras Fuqing y cabras Nubias
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Rendimiento de crecimiento
Grasa intramuscular
Análisis de RNA-Seq
Datos del transcriptoma
Desarrollo muscular
Deposición de IMF
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
En este estudio, medimos el rendimiento de crecimiento y el contenido de grasa intramuscular (IMF) del (LD) de cabras Fuqing (FQs) y cabras nubias (NBYs), que exhiben diferencias fenotípicas extremas en términos de sus rasgos de producción y calidad de carne. Se realizó un análisis de RNA-Seq y se obtuvieron datos del transcriptoma del tejido LD de fetos de 3 meses (E3), corderos de 0 meses (0M), corderos de 3 meses (3M) y corderos de 12 meses (12M) para revelar las diferencias en los mecanismos moleculares que regulan el desarrollo muscular y la deposición de IMF entre FQs y NBYs. Los resultados mostraron que se observó un mayor peso corporal y un aumento diario promedio en los NBYs en tres etapas de desarrollo después del nacimiento, mientras que se registró un mayor contenido de IMF en los FQs a los 12M. Además, los perfiles del transcriptoma durante el período embrionario y después del nacimiento fueron completamente diferentes para ambos, FQs y NBYs. Además, se identificaron DEGs que se enriquecieron significativamente en el ciclo celular (ko04110) en E3 (FQs vs. NBYs), y DEGs que se enriquecieron significativamente en ribosomas (ko03010) en 0M (FQs vs. NBYs) relacionados con la diferenciación y fusión miogénica. Mientras tanto, las diferencias en el metabolismo de la glucosa y los lípidos comenzaron en el punto de tiempo E3 y continuaron fortaleciéndose a medida que avanzaba el crecimiento en FQs vs. NBYs. Se identificaron DEGs en 3M (FQs vs. NBYs) y 12M (FQs vs. NBYs) que se enriquecieron significativamente en la vía de señalización AMPK (ko04152), resistencia a la insulina (ko04931), la vía de señalización de insulina (ko04910), metabolismo de ácidos grasos (ko01212) y glucólisis/gluconeogénesis (ko00010) relacionados con la deposición de IMF. Además, los resultados de este estudio proporcionan la base para futuros estudios sobre los mecanismos que regulan el desarrollo muscular y la deposición de IMF en diferentes razas de cabras, y los genes candidatos identificados podrían utilizarse en el proceso de selección.
Descripción
En este estudio, medimos el rendimiento de crecimiento y el contenido de grasa intramuscular (IMF) del (LD) de cabras Fuqing (FQs) y cabras nubias (NBYs), que exhiben diferencias fenotípicas extremas en términos de sus rasgos de producción y calidad de carne. Se realizó un análisis de RNA-Seq y se obtuvieron datos del transcriptoma del tejido LD de fetos de 3 meses (E3), corderos de 0 meses (0M), corderos de 3 meses (3M) y corderos de 12 meses (12M) para revelar las diferencias en los mecanismos moleculares que regulan el desarrollo muscular y la deposición de IMF entre FQs y NBYs. Los resultados mostraron que se observó un mayor peso corporal y un aumento diario promedio en los NBYs en tres etapas de desarrollo después del nacimiento, mientras que se registró un mayor contenido de IMF en los FQs a los 12M. Además, los perfiles del transcriptoma durante el período embrionario y después del nacimiento fueron completamente diferentes para ambos, FQs y NBYs. Además, se identificaron DEGs que se enriquecieron significativamente en el ciclo celular (ko04110) en E3 (FQs vs. NBYs), y DEGs que se enriquecieron significativamente en ribosomas (ko03010) en 0M (FQs vs. NBYs) relacionados con la diferenciación y fusión miogénica. Mientras tanto, las diferencias en el metabolismo de la glucosa y los lípidos comenzaron en el punto de tiempo E3 y continuaron fortaleciéndose a medida que avanzaba el crecimiento en FQs vs. NBYs. Se identificaron DEGs en 3M (FQs vs. NBYs) y 12M (FQs vs. NBYs) que se enriquecieron significativamente en la vía de señalización AMPK (ko04152), resistencia a la insulina (ko04931), la vía de señalización de insulina (ko04910), metabolismo de ácidos grasos (ko01212) y glucólisis/gluconeogénesis (ko00010) relacionados con la deposición de IMF. Además, los resultados de este estudio proporcionan la base para futuros estudios sobre los mecanismos que regulan el desarrollo muscular y la deposición de IMF en diferentes razas de cabras, y los genes candidatos identificados podrían utilizarse en el proceso de selección.