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Análisis de Diferencias entre Seis Tipos de Secuencias de Empalme Aceptores a Través de las Características de Dispersión de Subconjuntos de 6-mer en Genes Humanos

Autores: Si, Yangming; Li, Hong; Li, Xiaolong

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2025

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Acceso abierto

Artículo científico
2025

Análisis de Diferencias entre Seis Tipos de Secuencias de Empalme Aceptores a Través de las Características de Dispersión de Subconjuntos de 6-mer en Genes Humanos


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Construido
Conjunto de datos
Secuencias de empalme de aceptores de genes
Empalme alternativo
Características de dispersión
Subconjuntos de 6-mer.

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 21

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Primero construimos un conjunto de datos completo de secuencias de empalme de aceptores de genes humanos, que se clasificaron en empalme común, empalme constitutivo y modos de empalme alternativo. El empalme alternativo se subdividió aún más en sub-modos normales, exónicos e intrónicos. Utilizamos 16 características de dispersión de subconjuntos de 6-mer XY1 para descubrir las diferencias en la composición de secuencias entre los seis tipos de modos de empalme. Encontramos que las características de dispersión pueden distinguir efectivamente las diferencias entre los tres modos y entre los tres sub-modos. Nuestro estudio indica que las características de dispersión de los subconjuntos de 6-mer pueden revelar las diferencias en la correlación de bases en las secuencias de empalme de aceptores. Al explorar la correlación de bases, nuestro método es importante para estudiar secuencias funcionales.

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