Análisis de Diferencias entre Seis Tipos de Secuencias de Empalme Aceptores a Través de las Características de Dispersión de Subconjuntos de 6-mer en Genes Humanos
Autores: Si, Yangming; Li, Hong; Li, Xiaolong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Análisis de Diferencias entre Seis Tipos de Secuencias de Empalme Aceptores a Través de las Características de Dispersión de Subconjuntos de 6-mer en Genes Humanos
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Construido
Conjunto de datos
Secuencias de empalme de aceptores de genes
Empalme alternativo
Características de dispersión
Subconjuntos de 6-mer.
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 21
Citaciones: Sin citaciones
Primero construimos un conjunto de datos completo de secuencias de empalme de aceptores de genes humanos, que se clasificaron en empalme común, empalme constitutivo y modos de empalme alternativo. El empalme alternativo se subdividió aún más en sub-modos normales, exónicos e intrónicos. Utilizamos 16 características de dispersión de subconjuntos de 6-mer XY1 para descubrir las diferencias en la composición de secuencias entre los seis tipos de modos de empalme. Encontramos que las características de dispersión pueden distinguir efectivamente las diferencias entre los tres modos y entre los tres sub-modos. Nuestro estudio indica que las características de dispersión de los subconjuntos de 6-mer pueden revelar las diferencias en la correlación de bases en las secuencias de empalme de aceptores. Al explorar la correlación de bases, nuestro método es importante para estudiar secuencias funcionales.
Descripción
Primero construimos un conjunto de datos completo de secuencias de empalme de aceptores de genes humanos, que se clasificaron en empalme común, empalme constitutivo y modos de empalme alternativo. El empalme alternativo se subdividió aún más en sub-modos normales, exónicos e intrónicos. Utilizamos 16 características de dispersión de subconjuntos de 6-mer XY1 para descubrir las diferencias en la composición de secuencias entre los seis tipos de modos de empalme. Encontramos que las características de dispersión pueden distinguir efectivamente las diferencias entre los tres modos y entre los tres sub-modos. Nuestro estudio indica que las características de dispersión de los subconjuntos de 6-mer pueden revelar las diferencias en la correlación de bases en las secuencias de empalme de aceptores. Al explorar la correlación de bases, nuestro método es importante para estudiar secuencias funcionales.