El presente estudio investigó los posibles cambios en la estructura de las comunidades bacterianas y sus perfiles funcionales en las rizosferas de cultivadas en condiciones de campo (CK) y bosque de pinos (T). Las rizosferas de plantas de dos años se utilizaron para extraer ADN para secuenciación metagenómica y metabolitos para perfilación metabolómica. Los resultados revelaron un mayor peso de raíz (<0.05) en las plantas cultivadas bajo el bosque que en CK. La comunidad bacteriana rizosférica estaba compuesta principalmente por tres filos dominantes, incluidos Acidobacteria, Proteobacteria y Candidatus rokubacteria, que representaban el 75% de la población microbiana total. Entre ellos, Acidobacteria fue el taxón bacteriano más abundante, representando el 42.4% y el 40.4% de las poblaciones totales en CK y T, respectivamente. Las abundancias relativas de los géneros bacterianos revelaron que , y , fueron los géneros dominantes en ambos grupos. Comparativamente, se observó una mayor proporción de Proteobacteria a Acidobacteria en las rizosferas del bosque que en las condiciones de campo. y fueron identificados como taxones biomarcadores en las rizosferas del bosque, mientras que lo mismo podría decirse para los taxones pertenecientes a betaproteobacteria y gammaproteobacteria, Burkholderiales y Verrucomicrobia para las rizosferas de campo. No se observaron contenidos diferenciales de metabolitos entre los dos grupos de rizosfera, lo que indica que no hay efectos adversos de la cultivación en la calidad del suelo bajo plantación forestal.