La relación interespecífica entre los rasgos funcionales y el rendimiento de las plántulas de árboles puede ser inconsistente, potencialmente debido a la variación en las condiciones ambientales de un sitio a otro o de un micrositio a otro. Los estudios sobre los rasgos y el rendimiento de las plántulas a menudo se centran en los rasgos aéreos, a pesar de la importancia de la adquisición de recursos subterráneos y la asignación de biomasa a las funciones aéreas frente a las subterráneas. Aquí investigamos cómo las condiciones ambientales variables entre sitios inducen variación intraespecífica en los rasgos de nivel de órgano (aéreos, subterráneos) y de asignación de biomasa, afectando las relaciones interespecíficas entre estos rasgos y el rendimiento de las plántulas. Analizamos la expresión de rasgos para 12 rasgos de nivel de órgano y tres rasgos de asignación y sus relaciones con el crecimiento en altura (1716 plántulas) y la mortalidad (15,862 plántulas) para 26 especies de árboles en tres sitios a lo largo de un gradiente de sucesión forestal en Costa Rica. Encontramos diferencias intraespecíficas significativas entre sitios en todos los rasgos de asignación, pero solo en tres de siete rasgos de nivel de órgano aéreos y tres de cinco rasgos de nivel de órgano subterráneos. Los rasgos de asignación fueron mejores predictores del rendimiento de las plántulas que los rasgos de nivel de órgano. Las relaciones entre los rasgos de asignación y tanto el crecimiento como la mortalidad variaron entre todos los sitios, pero para los rasgos de nivel de órgano, solo las relaciones con el crecimiento variaron entre sitios. Estos resultados subrayan que la asignación de biomasa juega un papel clave en las primeras etapas de vida de los árboles y que las condiciones específicas del sitio pueden influir en cómo los rasgos funcionales median el establecimiento de las plántulas durante la sucesión.