Comparación de rendimiento de una implementación dúplex de la prueba CDC EUA 2019-nCoV con la prueba Allplex-SARS-CoV-2 de Seegene para la detección de SARS-CoV-2 en muestras de hisopos nasofaríngeos
Autores: Jiménez, Karen Marcela; Fonseca-Mendoza, Dora Janeth; Morel, Adrien; Ortega-Recalde, Oscar; Contreras Bravo, Nora Constanza; Velandia-Piedrahita, Camilo Andres; Steevens, Adriana; Caldas, Luisa Daniela; Ribón, Juan Pablo; Sánchez, Martha; Restrepo, Carlos Martin; Cabrera, Rodrigo
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Comparación de rendimiento de una implementación dúplex de la prueba CDC EUA 2019-nCoV con la prueba Allplex-SARS-CoV-2 de Seegene para la detección de SARS-CoV-2 en muestras de hisopos nasofaríngeos
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Bioingeniería
Palabras clave
Pruebas de rt-pcr
Virus sars-cov-2
Pandemia de covid-19
Laboratorios de diagnóstico
Extracción de ácido nucleico
Plataformas de amplificación.
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 24
Citaciones: Sin citaciones
Las pruebas de RT-PCR se han convertido en el estándar de oro para detectar el virus SARS-CoV-2 en el contexto de la pandemia de COVID-19. Debido al gran número de casos en oleadas periódicas de infección, existe una grave tensión financiera y logística en los laboratorios de diagnóstico. Por esta razón, son esenciales las implementaciones y validaciones alternativas de protocolos académicos que emplean el menor costo y los equipos y reactivos más ampliamente disponibles encontrados en diferentes regiones. En este estudio, informamos sobre una implementación alternativa del ensayo EUA 2019-nCoV CDC que utiliza una reacción de PCR dúplex previamente caracterizada para las regiones objetivo N1 y RNAse P y una reacción uniplex adicional para la región objetivo N2. Aprovechando el Sistema de Preparación de Muestras Abbott m2000 y el kit NEB Luna Universal Probe One-Step RT-qPCR, algunos de las plataformas de extracción y amplificación de ácidos nucleicos más ampliamente disponibles y económicas, esta prueba modificada muestra sensibilidades y especificidades analíticas y clínicas de última generación en comparación con el ensayo Seegene Allplex-SARS-CoV-2. Esta implementación tiene el potencial de ser verificada e implementada por laboratorios de diagnóstico en todo el mundo para garantizar pruebas de RT-PCR de bajo costo que puedan aprovechar equipos y reactivos ampliamente disponibles.
Descripción
Las pruebas de RT-PCR se han convertido en el estándar de oro para detectar el virus SARS-CoV-2 en el contexto de la pandemia de COVID-19. Debido al gran número de casos en oleadas periódicas de infección, existe una grave tensión financiera y logística en los laboratorios de diagnóstico. Por esta razón, son esenciales las implementaciones y validaciones alternativas de protocolos académicos que emplean el menor costo y los equipos y reactivos más ampliamente disponibles encontrados en diferentes regiones. En este estudio, informamos sobre una implementación alternativa del ensayo EUA 2019-nCoV CDC que utiliza una reacción de PCR dúplex previamente caracterizada para las regiones objetivo N1 y RNAse P y una reacción uniplex adicional para la región objetivo N2. Aprovechando el Sistema de Preparación de Muestras Abbott m2000 y el kit NEB Luna Universal Probe One-Step RT-qPCR, algunos de las plataformas de extracción y amplificación de ácidos nucleicos más ampliamente disponibles y económicas, esta prueba modificada muestra sensibilidades y especificidades analíticas y clínicas de última generación en comparación con el ensayo Seegene Allplex-SARS-CoV-2. Esta implementación tiene el potencial de ser verificada e implementada por laboratorios de diagnóstico en todo el mundo para garantizar pruebas de RT-PCR de bajo costo que puedan aprovechar equipos y reactivos ampliamente disponibles.