Los exosomas son vesículas biológicas secretadas y liberadas por las células que actúan como mediadores de la comunicación intercelular y desempeñan un papel único en la infección viral, la presentación de antígenos y la supresión/promoción de la inmunidad del cuerpo. El virus del síndrome reproductivo y respiratorio porcino (PRRSV) es uno de los patógenos más dañinos en la industria porcina y puede causar trastornos reproductivos en cerdas, enfermedades respiratorias en cerdos, reducción del rendimiento de crecimiento y otras enfermedades que conducen a la mortalidad porcina. En este estudio, utilizamos la cepa CHsx1401 similar a PRRSV NADC30 para infectar artificialmente a cerdos de 42 días y aislar exosomas séricos. Basado en tecnología de secuenciación de alto rendimiento, se identificaron 305 miARN en exosomas séricos antes y después de la infección, de los cuales 33 miARN se expresaron diferencialmente entre grupos (13 relativamente sobreexpresados y 20 relativamente subexpresados). El análisis de conservación de secuencias del genoma CHsx1401 identificó 8 regiones conservadas, de las cuales se predijo que un total de 16 miARN expresados diferencialmente (DE) se unirían a la región conservada más cercana al 3 UTR del genoma CHsx1401, incluyendo 5 miARN DE capaces de unirse al 3 UTR de CHsx1401 (ssc-miR-34c, ssc-miR-375, ssc-miR-378, ssc-miR-486, ssc-miR-6529). Un análisis adicional reveló que los genes objetivo de los miARN expresados diferencialmente estaban ampliamente involucrados en vías de señalización relacionadas con la función exosomal y la inmunidad innata, y se seleccionaron 18 miARN DE (ssc-miR-4331-3p, ssc-miR-744, ssc-miR-320, ssc-miR-10b, ssc-miR-124a, ssc-miR-128, etc.) asociados con la infección por PRRSV y la inmunidad como moléculas funcionales potenciales involucradas en la regulación de la infección por el virus PRRSV a través de exosomas.