El rápido desarrollo de vacunas efectivas contra la COVID-19 es un logro extraordinario. Sin embargo, ningún producto médico puede considerarse libre de riesgos. Varios países tienen un sistema de farmacovigilancia que detecta, evalúa, comprende y previene posibles efectos adversos de un medicamento. Para beneficiarse de tales enormes fuentes de datos, los especialistas e investigadores necesitan herramientas avanzadas de análisis de grandes datos capaces de extraer valor y encontrar información valiosa. Este documento define un marco general para una aplicación de análisis de datos farmacéuticos que proporciona un conjunto predefinido (pero extensible) de funciones para cada paso del procesamiento de datos (es decir, recolección de datos, filtrado, enriquecimiento, análisis y visualización). Como estudio de caso, presentamos aquí un análisis de los posibles efectos secundarios observados tras la administración de las vacunas contra la COVID-19. La evaluación experimental muestra que: (i) la mayoría de los eventos adversos pueden clasificarse como no graves y se refieren a dolor muscular/articular, escalofríos y náuseas, dolor de cabeza y fatiga; (ii) la tasa de notificación es más alta en el grupo de edad de 20 a 39 años y disminuye en grupos de edad mayores y en personas muy jóvenes.