En este documento, exploramos dos enfoques de modelado para comprender la dinámica de las enfermedades infecciosas en la población: el modelado basado en ecuaciones (EBM) y el modelado basado en agentes (ABM). Para lograr esto, se realizó un estudio comparativo de estos enfoques y destacamos sus ventajas y desventajas. Se llevaron a cabo dos estudios de caso sobre la propagación de la pandemia de COVID-19 utilizando ambos enfoques. Los resultados obtenidos muestran que los modelos basados en ecuaciones diferenciales son más rápidos pero aún simplistas, mientras que los modelos basados en agentes requieren más capacidades de máquina pero son más realistas y muy cercanos a la biología. Basándonos en estos resultados, parece que la combinación de ambos enfoques podría ser un compromiso interesante.