El uso intensivo de pesticidas ha generado preocupaciones ambientales debido a su persistencia y lenta degradación, lo que plantea riesgos ecotoxicológicos. A pesar de las medidas regulatorias, la aplicación de pesticidas sigue siendo alta, lo que conduce a la contaminación del suelo y del agua. Para monitorear y mitigar estos impactos de manera efectiva, es fundamental seleccionar un método de extracción apropiado y eficiente para detectar pesticidas en el suelo. Este estudio evaluó la efectividad de dos métodos de extracción en el suelo: QuEChERS y QuEChERSER, y evaluó la persistencia de tres pesticidas de uso común. Se realizó una prueba utilizando 13 estándares de pesticidas, que representan una amplia variedad de grupos funcionales, para comparar los dos métodos de extracción. Para el estudio de persistencia, se llevó a cabo un experimento de microcosmos con tres pesticidas seleccionados: pendimetalina, oxifluorfen y trifloxistrobina. Estos fueron elegidos debido a su relevancia agrícola, potencial toxicidad humana y persistencia en varios compartimentos ambientales. También se evaluó el impacto de dos enmiendas orgánicas en su disipación. Los microcosmos se incubaron en cámaras oscuras a temperatura ambiente durante 21 días, y las concentraciones de pesticidas se analizaron utilizando cromatografía líquida de ultra alto rendimiento-espectrometría de masas en tándem. Ambos métodos fueron efectivos, aunque el rendimiento varió según el compuesto. QuEChERSER resultó ser más eficiente, requiriendo menos tiempo y menos recursos que el método tradicional QuEChERS. Entre los tres pesticidas probados, el herbicida oxifluorfen fue el más persistente, mientras que el fungicida trifloxistrobina mostró la menor persistencia. La aplicación de enmiendas orgánicas mejoró la disipación de los tres pesticidas. Estos hallazgos destacan la importancia de seleccionar técnicas de extracción apropiadas y adoptar prácticas agrícolas sostenibles para mitigar los residuos de pesticidas en el medio ambiente.