Al aplicar tres tratamientos diferentes de luz LED, designados como azul (B), rojo (R)/azul (B), rojo (R) y luz blanca (W), así como el control, se examinó el efecto sobre el fenotipo (rendimiento y calidad), y el estado fisiológico, bioquímico y molecular, así como la eficiencia en el uso de recursos del sistema de cultivo. Observamos que las características básicas de las hojas, como el área foliar, el número de hojas, el contenido relativo de clorofila, así como las características de las raíces, como la longitud total de la raíz y la arquitectura de la raíz, no se vieron afectadas por los diferentes LEDs. El rendimiento expresado en peso fresco fue ligeramente menor en las luces LED que en el control (1113 g m), siendo la luz R la que produjo menos (679 g m). Sin embargo, los sólidos solubles totales se vieron significativamente afectados (máximo, 5.5 grados Brix, en luz R) y el FRAP mejoró en todas las luces LED (máximo, 191.8 g/g FW, en B) en comparación con el control, mientras que el contenido de nitratos fue menor (mínimo, 949.2 g/g FW, en R). La expresión diferencial de genes mostró que la luz LED B afectó a más genes en comparación con las luces R y R/B. Aunque el contenido total de fenoles mejoró bajo todas las luces LED (máximo, 1.05 mg/g FW, en R/B), no detectamos una cantidad significativa de DEGs en la vía del fenilpropanoide. La luz R impacta positivamente en la expresión de los genes que codifican componentes de la fotosíntesis. Por otro lado, el impacto positivo de la luz R en el SSC se debió posiblemente a la inducción de la expresión de genes clave, como . En resumen, esta investigación es un estudio integrador e innovador, donde se exploró el efecto de diferentes luces LED en el cultivo de rúcula bajo cultivo protegido, en un sistema de cultivo en cámara cerrada, a múltiples niveles.