Análisis de Señales de Selección a Nivel Genómico para Investigar la Amplia Divergencia de Herencia Genómica entre el Jabalí Salvaje Euroasiático y el Cerdo Doméstico
Autores: Wu, Xinming; Zhang, Haoyuan; Long, Haoyuan; Zhang, Dongjie; Yang, Xiuqin; Liu, Di; E, Guangxin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis de Señales de Selección a Nivel Genómico para Investigar la Amplia Divergencia de Herencia Genómica entre el Jabalí Salvaje Euroasiático y el Cerdo Doméstico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Cerdos
Evolución genética
Cerdos domésticos
CDGs
Selección
Haplotipos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 22
Citaciones: Sin citaciones
Como especies de ganado importantes, los cerdos proporcionan recursos cárnicos esenciales para los humanos, por lo que comprender la evolución genética detrás de su historia doméstica podría ayudar con la mejora genética de los cerdos domésticos. Este estudio tuvo como objetivo investigar la evolución de la convergencia y divergencia bajo selección en cerdos domésticos europeos y asiáticos utilizando datos genómicos públicos. Se obtuvieron un total de 164 y 108 genes candidatos (CDGs) del grupo asiático (jabalí vs. cerdo doméstico) y del grupo europeo (jabalí vs. cerdo doméstico), respectivamente, tomando el 5% superior de ventanas intersecadas de un índice de fijación por pares (FST) y una prueba de homocigosidad de haplotipos extendidos entre poblaciones (XPEHH). Los resultados anotados de GO y KEGG indicaron que la mayoría de los CDGs estaban relacionados con la reproducción y la inmunidad en el grupo asiático. Por el contrario, los CDGs ricos se enriquecieron en el desarrollo muscular y la digestión en el grupo europeo. Ocho CDGs fueron sometidos a selección paralela de cerdos domésticos euroasiáticos a partir de jabalíes locales durante la domesticación. Estos CDGs estaban principalmente involucrados en la transducción olfativa, las vías metabólicas y la maduración del ovocito mediada por progesterona. Además, se identificaron 36 y 18 haplotipos en este estudio, respectivamente. En resumen, este estudio no solo mejoró la comprensión de la evolución genética de la domesticación en cerdos, sino que también proporciona valiosos CDGs para la futura cría y mejora genética de los cerdos.
Descripción
Como especies de ganado importantes, los cerdos proporcionan recursos cárnicos esenciales para los humanos, por lo que comprender la evolución genética detrás de su historia doméstica podría ayudar con la mejora genética de los cerdos domésticos. Este estudio tuvo como objetivo investigar la evolución de la convergencia y divergencia bajo selección en cerdos domésticos europeos y asiáticos utilizando datos genómicos públicos. Se obtuvieron un total de 164 y 108 genes candidatos (CDGs) del grupo asiático (jabalí vs. cerdo doméstico) y del grupo europeo (jabalí vs. cerdo doméstico), respectivamente, tomando el 5% superior de ventanas intersecadas de un índice de fijación por pares (FST) y una prueba de homocigosidad de haplotipos extendidos entre poblaciones (XPEHH). Los resultados anotados de GO y KEGG indicaron que la mayoría de los CDGs estaban relacionados con la reproducción y la inmunidad en el grupo asiático. Por el contrario, los CDGs ricos se enriquecieron en el desarrollo muscular y la digestión en el grupo europeo. Ocho CDGs fueron sometidos a selección paralela de cerdos domésticos euroasiáticos a partir de jabalíes locales durante la domesticación. Estos CDGs estaban principalmente involucrados en la transducción olfativa, las vías metabólicas y la maduración del ovocito mediada por progesterona. Además, se identificaron 36 y 18 haplotipos en este estudio, respectivamente. En resumen, este estudio no solo mejoró la comprensión de la evolución genética de la domesticación en cerdos, sino que también proporciona valiosos CDGs para la futura cría y mejora genética de los cerdos.