Genes de fusión en el cáncer de próstata: una comparación en hombres de ascendencia africana y europea
Autores: Morgan, Rebecca; Keeley, Dulcie; Hazard, E. Starr; Allott, Emma H.; Wolf, Bethany; Savage, Stephen J.; Hughes Halbert, Chanita; Gattoni-Celli, Sebastiano; Hardiman, Gary
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Genes de fusión en el cáncer de próstata: una comparación en hombres de ascendencia africana y europea
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Cáncer de próstata
Genético
Genes de fusión
Afroamericano
Secuenciación de ARN
Estudios genómicos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 31
Citaciones: Sin citaciones
El cáncer de próstata es uno de los cánceres más prevalentes en todo el mundo, afectando particularmente a hombres que viven un estilo de vida occidental y de ascendencia africana, lo que sugiere factores de riesgo que son de naturaleza genética, ambiental y socioeconómica. En los EE. UU., los hombres afroamericanos (AA) se ven desproporcionadamente afectados, sufriendo en promedio de un grado más alto de la enfermedad y a una edad más joven en comparación con los hombres de ascendencia europea (EA). Los genes de fusión son productos quiméricos formados por la fusión de dos genes separados que ocurren como resultado de cambios estructurales cromosómicos, por ejemplo, inversión o empalme trans/cis de genes vecinos. Se conocen como impulsores del cáncer y se han identificado en el 20% de los cánceres. Las mejoras en las tecnologías genómicas, como la secuenciación de ARN, junto con mejores algoritmos para la predicción de genes de fusión, han aumentado nuestro conocimiento sobre fusiones genéticas específicas en los cánceres. En la actualidad, los AA están subrepresentados en estudios genómicos del cáncer de próstata. El objetivo principal de este estudio fue examinar las diferencias moleculares en los genes de fusión predichos en una cohorte de hombres AA y EA en el contexto del cáncer de próstata utilizando enfoques computacionales. Se purificó ARN de muestras de tejido prostático obtenidas en cirugía de sujetos inscritos en el estudio. Las predicciones de genes de fusión se realizaron utilizando cuatro programas diferentes de detección de genes de fusión. Esto identificó nuevas fusiones genéticas putativas únicas para los AA y sugirió que la carga de genes de fusión era mayor en los AA en comparación con los hombres EA.
Descripción
El cáncer de próstata es uno de los cánceres más prevalentes en todo el mundo, afectando particularmente a hombres que viven un estilo de vida occidental y de ascendencia africana, lo que sugiere factores de riesgo que son de naturaleza genética, ambiental y socioeconómica. En los EE. UU., los hombres afroamericanos (AA) se ven desproporcionadamente afectados, sufriendo en promedio de un grado más alto de la enfermedad y a una edad más joven en comparación con los hombres de ascendencia europea (EA). Los genes de fusión son productos quiméricos formados por la fusión de dos genes separados que ocurren como resultado de cambios estructurales cromosómicos, por ejemplo, inversión o empalme trans/cis de genes vecinos. Se conocen como impulsores del cáncer y se han identificado en el 20% de los cánceres. Las mejoras en las tecnologías genómicas, como la secuenciación de ARN, junto con mejores algoritmos para la predicción de genes de fusión, han aumentado nuestro conocimiento sobre fusiones genéticas específicas en los cánceres. En la actualidad, los AA están subrepresentados en estudios genómicos del cáncer de próstata. El objetivo principal de este estudio fue examinar las diferencias moleculares en los genes de fusión predichos en una cohorte de hombres AA y EA en el contexto del cáncer de próstata utilizando enfoques computacionales. Se purificó ARN de muestras de tejido prostático obtenidas en cirugía de sujetos inscritos en el estudio. Las predicciones de genes de fusión se realizaron utilizando cuatro programas diferentes de detección de genes de fusión. Esto identificó nuevas fusiones genéticas putativas únicas para los AA y sugirió que la carga de genes de fusión era mayor en los AA en comparación con los hombres EA.