Análisis transcriptómico comparativo de la cabeza en tras la infección del virus de la banda amarilla del arroz
Autores: Yu, Youxin; Zhang, Yuanyuan; Qian, Mingshi; Zhang, Qiuxin; Yang, Guoqing; Xu, Gang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Análisis transcriptómico comparativo de la cabeza en tras la infección del virus de la banda amarilla del arroz
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Virus de la banda del arroz
Pequeño saltahojas café
Expresiones génicas
Secuenciación de ARN
Perfiles de transcripción
Genes diferencialmente expresados
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 25
Citaciones: Sin citaciones
El virus de la banda del arroz (RSV) se transmite por el pequeño saltahojas marrón (SBPH), de manera circulativa-propagativa. Diversos estudios han demostrado que el RSV puede manipular los insectos vectores para facilitar su transmisión y puede alterar las expresiones génicas en el SBPH virulento. Sin embargo, hasta donde sabemos, nadie ha investigado las expresiones génicas en la cabeza del SBPH después de adquirir el RSV. En este estudio, para investigar los genes y funciones génicas regulados por la infección del RSV en la cabeza del SBPH, utilizamos secuenciación de ARN para comparar los perfiles de transcripción entre muestras de cabeza de SBPH que adquirieron RSV o no. En comparación con el SBPH no virulento, se identificaron un total de 336 genes diferencialmente expresados (DEGs) en las muestras de cabeza de los grupos de SBPH virulentos, incluyendo 186 genes regulados al alza y 150 genes regulados a la baja. Aquí nos enfocamos en los DEGs que pueden estar involucrados en la replicación o transmisión del RSV, principalmente genes asociados con el sistema nervioso, citocromo P450, metabolismo de azúcares, el sistema olfativo y el proceso cuticular, así como genes que han sido reportados previamente para afectar la transmisión de virus en vectores de insectos, incluyendo la ligasa de proteínas de ubiquitina (), el gen de respuesta a ecdisona () y el receptor de vitelogenina (). Finalmente, verificamos la precisión de los resultados de secuenciación del transcriptoma utilizando qRT-PCR al seleccionar 16 DEGs. Nuestros resultados pueden contribuir a la comprensión de los efectos de la infección por RSV en la regulación génica en la cabeza del SBPH y proporcionar información sobre el control de la transmisión de virus de plantas y vectores de insectos.
Descripción
El virus de la banda del arroz (RSV) se transmite por el pequeño saltahojas marrón (SBPH), de manera circulativa-propagativa. Diversos estudios han demostrado que el RSV puede manipular los insectos vectores para facilitar su transmisión y puede alterar las expresiones génicas en el SBPH virulento. Sin embargo, hasta donde sabemos, nadie ha investigado las expresiones génicas en la cabeza del SBPH después de adquirir el RSV. En este estudio, para investigar los genes y funciones génicas regulados por la infección del RSV en la cabeza del SBPH, utilizamos secuenciación de ARN para comparar los perfiles de transcripción entre muestras de cabeza de SBPH que adquirieron RSV o no. En comparación con el SBPH no virulento, se identificaron un total de 336 genes diferencialmente expresados (DEGs) en las muestras de cabeza de los grupos de SBPH virulentos, incluyendo 186 genes regulados al alza y 150 genes regulados a la baja. Aquí nos enfocamos en los DEGs que pueden estar involucrados en la replicación o transmisión del RSV, principalmente genes asociados con el sistema nervioso, citocromo P450, metabolismo de azúcares, el sistema olfativo y el proceso cuticular, así como genes que han sido reportados previamente para afectar la transmisión de virus en vectores de insectos, incluyendo la ligasa de proteínas de ubiquitina (), el gen de respuesta a ecdisona () y el receptor de vitelogenina (). Finalmente, verificamos la precisión de los resultados de secuenciación del transcriptoma utilizando qRT-PCR al seleccionar 16 DEGs. Nuestros resultados pueden contribuir a la comprensión de los efectos de la infección por RSV en la regulación génica en la cabeza del SBPH y proporcionar información sobre el control de la transmisión de virus de plantas y vectores de insectos.