A medida que la contaminación ambiental creciente resulta del desarrollo económico, la cadena de suministro verde es vital para mejorar la calidad ecológica. Dada la rápida expansión de las compras en línea, la cadena de suministro de doble canal ha ganado una popularidad significativa. Los gobiernos han implementado políticas para lograr picos de carbono y neutralidad a nivel mundial. Considerando la calidad verde y las preferencias de canal, este estudio construye un modelo de Stackelberg liderado por el fabricante dentro de una cadena de suministro de doble canal para comparar los efectos bajo dos estrategias de subsidio gubernamental. Se aplica un enfoque teórico de juegos de Stackelberg para analizar el modelo. Los hallazgos indican lo siguiente: (1) Los aumentos en el coeficiente de subsidio pueden aumentar la ecología del producto y la ganancia general en ambas estrategias de subsidio, lo cual tiene sentido; (2) Cuando los canales de venta directa se vuelven dominantes, subsidiar al fabricante resulta superior a subsidiar al minorista en términos de promover la calidad verde y la ganancia general, lo que amplía los estudios existentes sobre decisiones de subsidio gubernamental. Además, subsidiar al minorista puede afectar negativamente la ganancia total de la cadena de suministro; (3) De acuerdo con la literatura previa, se espera que la intensa competencia entre fabricantes y minoristas aumente la ganancia general de la cadena de suministro; (4) Interesantemente, la preferencia del cliente por los canales en línea no influye en la calidad verde del producto bajo estrategias de subsidio del fabricante, pero muestra un impacto negativo bajo estrategias de subsidio del minorista. Finalmente, esta investigación proporciona implicaciones gerenciales para tomadores de decisiones y posibles problemas para investigaciones futuras.