El gran aumento en la producción ganadera en algunas áreas de Europa hace necesario reciclar purines y estiércoles orgánicos e integrarlos en la producción de cultivos. En el noreste de España, la aplicación de purín de cerdo (PS) se está extendiendo a cultivos alternativos como el arroz debido al gran aumento en la producción porcina. Sin embargo, existe una falta de información sobre el efecto de la sustitución de fertilizantes sintéticos por purín de cerdo en las emisiones de gases de efecto invernadero (GEI) en el cultivo de arroz, y esta información es clave para la sostenibilidad de estos sistemas agrícolas. El objetivo de este estudio fue evaluar el efecto de la sustitución de fertilizantes minerales por PS en las emisiones de GEI en condiciones de cultivo de arroz inundado mediterráneo bajo una fertilización óptima de nitrógeno (N). Se llevaron a cabo dos experimentos de campo en dos tipos de suelo diferentes (contrastantes) con diferentes prácticas de manejo de tierras. El sitio 1 había sido cultivado con arroz en los tres años anteriores sin prácticas de arado. El sitio 2 había sido cultivado con arroz durante más de 15 años con prácticas de labranza y tenía un contenido de materia orgánica más alto que el sitio 1. Las emisiones acumulativas de óxido nitroso durante la temporada de cultivo fueron negativas en ambos sitios, corroborando que bajo condiciones inundadas, el metano es el principal contribuyente al potencial de calentamiento global en lugar del óxido nitroso. La sustitución de fertilizante mineral por PS antes de la siembra a la misma tasa de N no aumentó las emisiones en ambos sitios. Sin embargo, en el sitio 1 (suelo con menor contenido de materia orgánica), la mayor tasa de PS aplicada antes de la siembra (170 kg N ha) aumentó las emisiones de metano en comparación con los tratamientos con menor tasa de PS y fertilizante mineral antes de la siembra (120 kg N ha) y complementados con fertilizante mineral de cobertura N. Por lo tanto, una estrategia sostenible para la inclusión de PS en la fertilización del arroz es la aplicación de tasas moderadas de PS antes de la siembra (~120 kg N ha) complementadas con fertilizante mineral de cobertura N.