Los patrones de cultivo pueden causar alteraciones en la estructura del suelo. Sin embargo, pocos estudios han aclarado la influencia del patrón de cultivo y la profundidad del suelo en el suelo. El propósito de este experimento fue estudiar las características de la comunidad de microorganismos del suelo en las capas de 0-10 cm y 10-20 cm debajo de los campos de arroz bajo patrones de cultivo orgánico y convencional, y revelar el mecanismo de respuesta de la comunidad microbiana a los patrones de cultivo a través del análisis de correlación del contenido de nutrientes del suelo, la actividad enzimática y las phyla dominantes microbianas, para proporcionar una base teórica para el cultivo de arroz de alto rendimiento desde la perspectiva de los microorganismos.