Los oocitos son eficientes en la reprogramación de células terminalmente diferenciadas a un estado totipotente. Las técnicas de transferencia nuclear pueden aprovechar esta propiedad para producir animales clonados. Sin embargo, la eficiencia general es baja. El uso de células madre mesenquimatosas del cordón umbilical (UC-MSCs) como núcleos donantes puede aumentar las tasas de blastocistos, pero las razones exactas de esto siguen sin explorarse. Se utilizó un enfoque de transcriptómica de una sola célula para mapear los perfiles transcriptómicos de embriones de ocho células que fueron fertilizados in vitro y clonados a mano utilizando células madre mesenquimatosas del cordón umbilical y fibroblastos como donantes nucleares. Se examinaron las diferencias a nivel de la cromatina, el nivel de genes expresados diferencialmente, el nivel de modificaciones de histonas y el nivel de metilación del ADN. Esta investigación proporciona información crítica sobre el uso de UC-MSCs como un núcleo donante preferido para técnicas de transferencia nuclear. También ofrece perspectivas únicas sobre el mecanismo de reprogramación celular.