Después del parto, ocurre una rápida transición del medio intrauterino al medio extrauterino, exponiendo a los neonatos a circunstancias fisiológicas caracterizadas por condiciones oxidativas que instigan la generación de especies reactivas de oxígeno. Estos radicales libres juegan roles fundamentales en los procesos fisiológicos; sin embargo, un desequilibrio entre su producción y la eliminación de antioxidantes puede resultar en un daño celular severo. El objetivo principal de este estudio fue comparar los perfiles oxidativos y antioxidantes en neonatos de mula y caballo inmediatamente después del parto, así como en puntos de tiempo posteriores (1, 6, 12 y 24 h, 7 y 30 días) durante su existencia extrauterina. Los parámetros evaluados incluyeron las concentraciones sistémicas de Sustancias Reactivas al Ácido Tiobarbitúrico (TBARS) y grupos carbonilo; las actividades de los antioxidantes superóxido dismutasa (SOD) y glutatión peroxidasa (GPx); y los niveles de bilirrubina total, indirecta y directa. Nuestros resultados no mostraron un efecto de interacción entre los grupos neonatales y los puntos de tiempo evaluados para las variables en investigación. Notablemente, las concentraciones de TBARS, como marcador de peroxidación lipídica, y bilirrubina fueron consistentemente más bajas en las mulas, mientras que la actividad de glutatión peroxidasa (GPx) mostró niveles más altos en este grupo. Los niveles de bilirrubina se redujeron notablemente en los neonatos de mula. Los TBARS demostraron una disminución progresiva durante el período de observación en ambos grupos, mientras que la actividad de GPx se mantuvo relativamente estable desde el nacimiento hasta los 7 días, con un aumento sustancial evidente en el marco de los 30 días. La oxidación de proteínas no se vio afectada por el grupo y el tiempo, mientras que para los valores de SOD, todos los tiempos fueron estadísticamente similares, excepto por la menor actividad en T1h. En consecuencia, nuestros hallazgos nos llevan a la conclusión de que los neonatos de mula y caballo manifiestan patrones distintos de actividad oxidativa y capacidad antioxidante durante el primer mes de su existencia extrauterina, potencialmente indicativos de diferentes mecanismos de adaptación al entorno extrauterino.