El cálculo dental, un importante contribuyente a la enfermedad periodontal canina, crea un ambiente ideal para que las bacterias orales se adhieran y colonizen. Sin embargo, los cambios composicionales y las diferencias en la comunidad microbiana oral durante la formación del cálculo dental canino siguen siendo poco caracterizados. Aclarar estos cambios microbianos podría mejorar las estrategias de diagnóstico y tratamiento temprano para la enfermedad periodontal canina. En nuestro estudio, incluimos 30 perros, que fueron divididos en tres grupos, y recolectamos muestras orales de cada individuo. Analizamos la composición bacteriana del microbioma oral a través de la secuenciación del gen de ARN ribosomal 16S (regiones V1-V9). Nuestros hallazgos revelaron diferencias significativas en la composición de la comunidad microbiana oral y en las vías metabólicas predichas entre perros sanos y aquellos afectados por placa o cálculo. Es importante destacar que se identificaron marcadores taxonómicos distintos a nivel de filo, género y especie, que pueden servir como biomarcadores potenciales para la formación de cálculo e incluso para la periodontitis. Sin embargo, los roles mecánicos de estas especies en el desarrollo del cálculo requieren una investigación adicional.