La carne de conejo se considera una opción superior entre las carnes de ganado y aves de corral debido a su alto contenido de proteínas, alta lisina y alta digestibilidad, así como su bajo contenido de grasa, bajo colesterol y bajo contenido calórico. Los factores genéticos que subyacen al sabor distintivo de la carne y otras características del conejo negro Minxinan (MBR), un conejo indígena chino, siguen estando poco caracterizados. Se investigó la base genética de la calidad superior de la carne del MBR indígena comparándolo con el conejo Hyla introducido (CIR) utilizando análisis multi-ómicos y fenotípicos. El MBR demostró una mejor capacidad antioxidante, sabor, perfil de ácidos grasos y color de la carne (aumento de la rojez, amarillez, melanina y mioglobina), subrayando su valor como un recurso alimentario y de cría premium. Estas características están vinculadas a vías clave, particularmente el metabolismo del glutatión, desempeñando un papel fundamental en la regulación de la calidad de la carne, modulando simultáneamente la actividad antioxidante y el color de la carne, donde se identificaron genes y proteínas novedosos (por ejemplo, GGCT, SOD1). El sabor mejorado se asoció con un metabolismo alterado de ácidos grasos y purinas, mediado por proteínas como ACSL6 y NME2/NME4. Creemos que este estudio proporciona una base teórica para apoyar el consumo de carne de MBR y seleccionar el MBR como material de cría para futuras razas de conejos, ofreciendo a los consumidores una referencia más completa al seleccionar carnes de ganado y aves de corral.