Predicciones Genómicas en Vacas Hanwoo Koreanas: Un Análisis Comparativo de BLUP Genómico y Métodos Bayesianos para Rasgos Reproductivos
Autores: Haque, Md Azizul; Lee, Yun-Mi; Ha, Jae-Jung; Jin, Shil; Park, Byoungho; Kim, Nam-Young; Won, Jeong-Il; Kim, Jong-Joo
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Predicciones Genómicas en Vacas Hanwoo Koreanas: Un Análisis Comparativo de BLUP Genómico y Métodos Bayesianos para Rasgos Reproductivos
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Valores genéticos de cría estimados genómicamente
GBLUP
BayesB
BayesLASSO
BayesR
Rasgos reproductivos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 6
Citaciones: Sin citaciones
Este estudio tuvo como objetivo predecir la precisión de los valores genómicos estimados de cría (GEBVs) para rasgos reproductivos en vacas Hanwoo utilizando los métodos GBLUP, BayesB, BayesLASSO y BayesR. Las estimaciones de precisión de los GEBVs para rasgos reproductivos se derivaron a través de una validación cruzada de cinco pliegues, analizando un conjunto de datos que comprende 11,348 animales y empleando un chip SNP Bovina 50K de Illumina. GBLUP mostró una precisión de 0.26 para AFC, mientras que BayesB, BayesLASSO y BayesR demostraron valores de 0.28, 0.29 y 0.29, respectivamente. Para CI, GBLUP alcanzó una precisión de 0.19, mientras que BayesB, BayesLASSO y BayesR obtuvieron 0.21, 0.24 y 0.25, respectivamente. La precisión para GL fue uniforme entre GBLUP, BayesB y BayesR en 0.31, mientras que BayesLASSO mostró una precisión ligeramente superior de 0.33. Para NAIPC, GBLUP mostró una precisión de 0.24, mientras que BayesB, BayesLASSO y BayesR registraron 0.22, 0.27 y 0.30, respectivamente. La variación en la precisión de la predicción genómica entre los métodos indicó que los enfoques bayesianos superaron ligeramente a GBLUP. Los hallazgos sugieren que los métodos bayesianos, en particular BayesLASSO y BayesR, ofrecen capacidades predictivas mejoradas para rasgos reproductivos. La investigación futura puede explorar enfoques genómicos más avanzados para mejorar la precisión predictiva y los avances genéticos en los programas de cría de ganado Hanwoo.
Descripción
Este estudio tuvo como objetivo predecir la precisión de los valores genómicos estimados de cría (GEBVs) para rasgos reproductivos en vacas Hanwoo utilizando los métodos GBLUP, BayesB, BayesLASSO y BayesR. Las estimaciones de precisión de los GEBVs para rasgos reproductivos se derivaron a través de una validación cruzada de cinco pliegues, analizando un conjunto de datos que comprende 11,348 animales y empleando un chip SNP Bovina 50K de Illumina. GBLUP mostró una precisión de 0.26 para AFC, mientras que BayesB, BayesLASSO y BayesR demostraron valores de 0.28, 0.29 y 0.29, respectivamente. Para CI, GBLUP alcanzó una precisión de 0.19, mientras que BayesB, BayesLASSO y BayesR obtuvieron 0.21, 0.24 y 0.25, respectivamente. La precisión para GL fue uniforme entre GBLUP, BayesB y BayesR en 0.31, mientras que BayesLASSO mostró una precisión ligeramente superior de 0.33. Para NAIPC, GBLUP mostró una precisión de 0.24, mientras que BayesB, BayesLASSO y BayesR registraron 0.22, 0.27 y 0.30, respectivamente. La variación en la precisión de la predicción genómica entre los métodos indicó que los enfoques bayesianos superaron ligeramente a GBLUP. Los hallazgos sugieren que los métodos bayesianos, en particular BayesLASSO y BayesR, ofrecen capacidades predictivas mejoradas para rasgos reproductivos. La investigación futura puede explorar enfoques genómicos más avanzados para mejorar la precisión predictiva y los avances genéticos en los programas de cría de ganado Hanwoo.