La estructura y propiedades fisicoquímicas del almidón eran factores importantes para determinar la calidad del mijo de cola de zorro. Aunque el mijo de cola de zorro híbrido ha logrado un mayor progreso en rendimiento, ha avanzado más lentamente en calidad que el mijo de cola de zorro convencional con una base genética más compleja, que fue influenciada conjuntamente por los padres. Sin embargo, no hubo informes sobre la comparación de la estructura del almidón y propiedades fisicoquímicas de los mijo de cola de zorro híbridos y sus padres. En este estudio, se analizaron el contenido de amilosa, la estructura de morfología, la distribución del tamaño de gránulo, la difracción de rayos X, la estructura ordenada a corto plazo, las propiedades de pasta y las características térmicas de los almidones derivados de Changzagu 466 (466), Changzagu 333 (333), Changzagu 2922 (2922) y sus materiales parentales. Los resultados mostraron que en comparación con los padres machos, los almidones de los tres mijo de cola de zorro híbridos y sus padres femeninos tenían un tamaño de partícula promedio más grande, d(0.1), d(0.5) y entalpía de gelatinización (H) mayores, mientras que los valores de contenido de amilosa de los tres mijo de cola de zorro híbridos eran del 26.0%, 28.8% y 28.9%, que estaban entre los padres (25.8~27.1%, 25.4~28.8% y 23.6~29.5%), con una temperatura de conclusión (Tc) más alta que los padres y con una viscosidad de descomposición más baja. La viscosidad pico de Changzagu 466 (466) y Changzagu 2922 (2922) fue de 5235.5 cP y 5190.8 cP, respectivamente, más baja que la de sus padres (5321.0~6006.0 cP y 5257.0~5580.7 cP), mientras que la viscosidad pico de Changzagu 333 (333) fue de 5473.8 cP, quedando entre los valores parentales (5337.5~5639.5 cP). Los resultados del análisis de conglomerados mostraron que la estructura del almidón y las propiedades fisicoquímicas del mijo de cola de zorro híbrido eran significativamente diferentes de las de los padres femeninos, que fueron principalmente influenciadas por los padres machos. Los hallazgos de este estudio establecerán una base teórica para la mejora e innovación de los recursos genéticos de alto calidad del mijo de cola de zorro, así como el desarrollo de combinaciones de mijo de cola de zorro híbrido de alta calidad.