La necesidad de utilizar fuentes renovables y matrices con potencial energético es ampliamente reconocida. El desarrollo de tecnologías innovadoras destinadas a mejorar los procesos de conversión de energía y reducir los impactos ambientales está recibiendo actualmente una atención creciente por parte de la comunidad científica y los responsables de políticas. La presencia de azúcares en los materiales de partículas en el aire se atribuye a la combustión de biomasa. Por esta razón, estos compuestos se consideran marcadores de la quema de biomasa. El propósito de este trabajo fue evaluar las emisiones producidas por la quema de biomasa agroforestal (poda de cítricos) mediante el muestreo simultáneo de las emisiones de la chimenea y de las partículas atmosféricas en el área alrededor de una caldera de biomasa para entender la verdadera contribución de la quema de biomasa a la contaminación atmosférica. Las pruebas de combustión se llevaron a cabo comparando los procesos con y sin sistema de reducción de partículas para ver cómo se puede controlar y reducir la contribución de la combustión de biomasa a la emisión de partículas. Durante las pruebas, el enfoque estuvo en la especiación de material particulado (PM) en términos de identificación y determinación de marcadores de azúcares. Este estudio tiene como objetivo aumentar el conocimiento para comprender mejor la contribución de las plantas de biomasa a la contaminación del aire y diferenciarla de las contribuciones de otras fuentes, como el tráfico vehicular o la calefacción doméstica.