La indole sintasa (INS), una enzima citosólica homóloga de la sintasa de triptófano A (TSA) plastidial, ha sido reportada como la primera enzima en la vía de síntesis de auxina independiente de triptófano. Esta sugerencia fue cuestionada ya que INS o su producto de indole libre pueden interactuar con la sintasa de triptófano B (TSB) y, por lo tanto, con la vía dependiente de triptófano. Así, el objetivo principal de esta investigación fue averiguar si INS está involucrada en la vía dependiente o independiente de triptófano. El enfoque de coexpresión génica es ampliamente reconocido como una herramienta eficiente para descubrir genes funcionalmente relacionados. Los datos de coexpresión presentados aquí fueron respaldados por plataformas de RNAseq y microarrays y, por lo tanto, se consideran fiables. Se implementaron meta-análisis de coexpresión del genoma de Arabidopsis para comparar la coexpresión de y con todos los genes involucrados en la producción de triptófano a través de la vía del corismato. Se encontró que la sintasa de triptófano A estaba coexpresada fuertemente con , , , así como con . Sin embargo, no se encontró que estuviera coexpresada con ningún gen objetivo, lo que sugiere que puede estar involucrada exclusivamente e independientemente en la vía independiente de triptófano. Además, se describieron las anotaciones de los genes examinados como ubicuos o expresados diferencialmente y se sugirieron genes codificadores de subunidades disponibles para el ensamblaje del complejo de sintasa de triptófano y antranilato. Se espera que las subunidades TSB más probables que interactúen con TSA sean TSB1 y luego TSB2. Mientras que TSB3 solo se utiliza en condiciones hormonales limitadas para ensamblar el complejo de sintasa de triptófano, no se espera que la TSB4 putativa esté involucrada en la síntesis plastidial de triptófano en Arabidopsis.