La endogamia es inevitable en poblaciones pequeñas. Sin embargo, los efectos perjudiciales de la endogamia en rasgos relacionados con la aptitud (depresión por endogamia) pueden no ser un fenómeno inevitable, ya que los alelos recesivos perjudiciales que causan depresión por endogamia podrían ser eliminados de las poblaciones a través de la endogamia y la selección. La eliminación de la endogamia ha sido de gran interés en la biología de la conservación y la cría de animales, porque se podrían crear poblaciones que manifiesten una menor depresión por endogamia incluso con un pequeño número de animales reproductores, si existe la eliminación de la endogamia. Hasta la fecha, se han llevado a cabo muchos estudios destinados a detectar la eliminación de la endogamia en poblaciones de animales en cautiverio y domesticados utilizando análisis de pedigrí. El coeficiente de endogamia ancestral de Ballou es una de las medidas más utilizadas para detectar la eliminación de la endogamia, pero la base teórica para ello no se ha establecido completamente. En la mayoría de los trabajos publicados, se han utilizado estimaciones de simulación estocástica (simulación de caída de genes). En este informe, el autor proporciona una base matemática para ello y propone una nueva estimación mediante la hibridación de procesos de cálculo estocásticos y deterministas. Una simulación estocástica sugiere que el método propuesto podría reducir considerablemente la varianza de las estimaciones, en comparación con la simulación ordinaria de caída de genes, en la que las transmisiones de genes enteros en un pedigrí se determinan de manera estocástica. La propiedad favorable del método propuesto resulta de eludir una parte del proceso estocástico en la simulación ordinaria de caída de genes. Utilizando el método propuesto, la fiabilidad de las estimaciones podría mejorarse notablemente. También se discute la relación entre este coeficiente y otros parámetros basados en el pedigrí.