Las leptospiras saprófitas son espiroquetas encerradas dentro del clado no patógeno del género, que a su vez se subdivide en dos subclados, S1 y S2. Hasta la fecha, los microorganismos incluidos en estos subclados han sido aislados del medio ambiente en varias partes del mundo y se cree que no tienen reservorios animales conocidos. Después de que se notificara un caso del serovar Pomona al propietario de una granja en Cerdeña, todos los animales de la granja (11 cerdos y 3 burros) fueron examinados en busca de la presencia de . Los sueros de todos los animales analizados resultaron positivos para anticuerpos utilizando una prueba de aglutinación microscópica (MAT). Además, nueve (82%) muestras de riñón de cerdos y tres muestras de orina recolectadas de burros (100%) dieron positivo para ADN después de qPCR. Los resultados obtenidos tras el análisis de MLST y la secuenciación de los genes , , y , realizados en seis cepas aisladas en cultivo, revelaron la presencia de la genomoespecie serovar Pomona en las muestras de riñón. Por el contrario, la secuenciación de genoma completo combinada con la identidad media de nucleótidos reveló la presencia de la saprófita en las muestras de orina. Nuestros resultados informan, por primera vez, el aislamiento de una especie saprófita de orina de mamíferos, sugiriendo una nueva especialización ecológica para estas bacterias, con una posible transición de vida libre a un estilo de vida simbiótico. Se deberán realizar más estudios para comprender la evolución de la virulencia de estas bacterias, su potencial infectividad y las posibles implicaciones para la salud pública.