El arroz jazmín (L.), o Khao Dawk Mali 105 (KDML105), es sensible a la sequía y a las tensiones salinas. En este estudio, se evaluaron dos líneas de sustitución de segmentos cromosómicos (CSSLs) mejoradas y tolerantes a la sequía de KDML105 (CSSL8-103 y CSSL8-106), que llevan loci de rasgos cuantitativos de tolerancia a la sequía en el cromosoma 8, para la tolerancia a la sal y se compararon con KDML105 y el donante de loci DH103, sus padres y el genotipo tolerante a la sal Pokkali. Después de ser sometidas a estrés salino durante 6 días, las plántulas de 3 semanas de edad de Pokkali mostraron la mayor tolerancia a la sal. Los parámetros relacionados con la fotosíntesis fueron menos inhibidos en ambas CSSLs y en el donante DH103, mientras que estos parámetros fueron más severamente dañados en el padre recurrente KDML105. Aunque la proporción de Na/K fue alta, las CSSLs y DH103 mostraron contenidos similares o mayores de azúcar soluble y actividad de superóxido dismutasa (SOD; EC1.15.1.1) en comparación con Pokkali, lo que indica posibles mecanismos de tolerancia tisular u osmótica en estas plantas. La expresión de un gen putativo (aminotransferasa), que está ubicado en DT-QTL y está involucrado en la biosíntesis de clorofila, disminuyó significativamente bajo estrés salino en KDML105 y CSSL8-103, mientras que no se observó un cambio obvio en la expresión de este gen en Pokkali, DH103 y CSSL8-106. Este gen podría desempeñar un papel en el mantenimiento del contenido de clorofila bajo condiciones de estrés. En conjunto, los resultados de este estudio indican que los DT-QTL podrían contribuir a la mejora del rendimiento fotosintético en las líneas CSSL, lo que lleva a cambios en su capacidad fisiológica para tolerar el estrés por salinidad.