Clonación y Análisis de Expresión de la Familia de Genes (Autophagy-Related 8) en Solanáceas
Autores: Chen, Yahan; Lu, Yunshuang; Dong, Shibo; Yang, Chengde; Yang, Shunyi
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Clonación y Análisis de Expresión de la Familia de Genes (Autophagy-Related 8) en Solanáceas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Autofagia
Familia de genes
Estructura de proteínas
Relaciones filogenéticas
Expresión génica
Resistencia a enfermedades
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
La familia de genes relacionados con la autofagia (Autophagy-related 8) juega un papel importante en el crecimiento, desarrollo y respuesta al estrés de las plantas. En este estudio, se amplificaron 15 secuencias de la familia de genes de Solanáceas, a saber, tabaco, tomate y pimiento, utilizando RT-PCR para evaluar sus propiedades básicas, estructura de proteínas y función, así como el papel en la autofagia. Se analizaron las propiedades fisicoquímicas, las estructuras secundarias y terciarias de proteínas predichas, la localización subcelular, las estructuras genéticas, los motivos conservados y las relaciones filogenéticas de los genes utilizando técnicas bioinformáticas, y se investigaron sus patrones de expresión bajo la resistencia a enfermedades inducida por sericina mediante RT-qPCR. Las longitudes de estas proteínas variaron de 79 a 120 aa, mientras que sus pesos moleculares predichos y puntos isoeléctricos variaron de 9283.62 a 13,778.74 y de 6.32 a 11.44, respectivamente. La mayoría de las proteínas se localizaron en el núcleo o en los cloroplastos. Se identificaron motivos de proteínas conservados y varios elementos cis-reguladores en la proteína, con una amplia gama de funciones relacionadas. Los miembros de la familia de genes mostraron cambios en la expresión después del tratamiento con osthole, que induce resistencia a enfermedades en tabaco, tomate y pimiento. Estos hallazgos proporcionan una base para análisis adicionales de la familia de genes en Solanáceas y el mecanismo subyacente a la respuesta a condiciones adversas.
Descripción
La familia de genes relacionados con la autofagia (Autophagy-related 8) juega un papel importante en el crecimiento, desarrollo y respuesta al estrés de las plantas. En este estudio, se amplificaron 15 secuencias de la familia de genes de Solanáceas, a saber, tabaco, tomate y pimiento, utilizando RT-PCR para evaluar sus propiedades básicas, estructura de proteínas y función, así como el papel en la autofagia. Se analizaron las propiedades fisicoquímicas, las estructuras secundarias y terciarias de proteínas predichas, la localización subcelular, las estructuras genéticas, los motivos conservados y las relaciones filogenéticas de los genes utilizando técnicas bioinformáticas, y se investigaron sus patrones de expresión bajo la resistencia a enfermedades inducida por sericina mediante RT-qPCR. Las longitudes de estas proteínas variaron de 79 a 120 aa, mientras que sus pesos moleculares predichos y puntos isoeléctricos variaron de 9283.62 a 13,778.74 y de 6.32 a 11.44, respectivamente. La mayoría de las proteínas se localizaron en el núcleo o en los cloroplastos. Se identificaron motivos de proteínas conservados y varios elementos cis-reguladores en la proteína, con una amplia gama de funciones relacionadas. Los miembros de la familia de genes mostraron cambios en la expresión después del tratamiento con osthole, que induce resistencia a enfermedades en tabaco, tomate y pimiento. Estos hallazgos proporcionan una base para análisis adicionales de la familia de genes en Solanáceas y el mecanismo subyacente a la respuesta a condiciones adversas.