Clasificación de Bananas Usando Secuenciación Sanger de la Región del Espaciador Interno Transcrito (ITS) del ADN Ribosomal
Autores: Zeng, Hongyun; Huang, Bingzhi; Xu, Linbing; Wu, Yuanli
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Clasificación de Bananas Usando Secuenciación Sanger de la Región del Espaciador Interno Transcrito (ITS) del ADN Ribosomal
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Banana
Tipos de genoma
Recursos de germoplasma
Secuenciación
ITS
Identificación
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
El plátano ( spp.) es uno de los cultivos hortícolas más importantes desde el punto de vista económico. Existen muchos tipos de plátano, con diferentes ploidías (generalmente diploide, triploide o tetraploide) y tipos de genoma (la mayoría contiene el genoma A y/o B). Actualmente, la observación y la detección del tipo de genoma se utilizan comúnmente para identificar recursos de germoplasma de plátano. Sin embargo, la observación es tediosa, mientras que la detección del tipo de genoma no puede distinguir categorías por debajo de los tipos de genoma. Por lo tanto, es urgente establecer un método simple y efectivo para identificar recursos de germoplasma de plátano. Este estudio secuenció y analizó las secuencias del espaciador transcrito interno (ITS) del ADN ribosómico de 62 recursos de germoplasma de plátano y encontró que los picos de secuenciación, especialmente la región de 20 pb cerca de la posición de 420 pb (denominada región de 420 pb), exhibieron características de polimorfismo relativamente reconocibles y repetibles. Usando la región de 420 pb como marcador, pudimos distinguir rápidamente los plátanos que pertenecen a diferentes grupos de tipos de genoma o diferentes subgrupos en el mismo grupo de tipo de genoma. Además, parecía que la secuenciación de Sanger de ITS podría utilizarse para identificar descendencia híbrida de plátano. En general, la secuenciación de ITS simplifica la clasificación de los recursos de germoplasma de plátano y tiene una aplicación potencial en varias áreas de mejora.
Descripción
El plátano ( spp.) es uno de los cultivos hortícolas más importantes desde el punto de vista económico. Existen muchos tipos de plátano, con diferentes ploidías (generalmente diploide, triploide o tetraploide) y tipos de genoma (la mayoría contiene el genoma A y/o B). Actualmente, la observación y la detección del tipo de genoma se utilizan comúnmente para identificar recursos de germoplasma de plátano. Sin embargo, la observación es tediosa, mientras que la detección del tipo de genoma no puede distinguir categorías por debajo de los tipos de genoma. Por lo tanto, es urgente establecer un método simple y efectivo para identificar recursos de germoplasma de plátano. Este estudio secuenció y analizó las secuencias del espaciador transcrito interno (ITS) del ADN ribosómico de 62 recursos de germoplasma de plátano y encontró que los picos de secuenciación, especialmente la región de 20 pb cerca de la posición de 420 pb (denominada región de 420 pb), exhibieron características de polimorfismo relativamente reconocibles y repetibles. Usando la región de 420 pb como marcador, pudimos distinguir rápidamente los plátanos que pertenecen a diferentes grupos de tipos de genoma o diferentes subgrupos en el mismo grupo de tipo de genoma. Además, parecía que la secuenciación de Sanger de ITS podría utilizarse para identificar descendencia híbrida de plátano. En general, la secuenciación de ITS simplifica la clasificación de los recursos de germoplasma de plátano y tiene una aplicación potencial en varias áreas de mejora.