La resección hepática es el tratamiento principal para tumores hepáticos primarios y metastásicos con el fin de lograr una supervivencia a largo plazo con buena calidad de vida. El objetivo final de la oncología quirúrgica es lograr la extirpación completa del tumor con márgenes quirúrgicos claros adecuados. La citometría de flujo es una técnica analítica poderosa con aplicaciones como el análisis fenotípico y la cuantificación del contenido de ADN. La citometría de flujo intraoperatoria (iFC) es la aplicación de la citometría de flujo para el análisis del contenido de ADN/ploidía y la distribución del ciclo celular durante la cirugía para el análisis de células tumorales y la evaluación de márgenes. Se ha utilizado para el análisis de células de tumores intracraneales y recientemente de carcinomas de cabeza y cuello y carcinomas de mama, así como para la evaluación de márgenes tumorales. Aquí presentamos un nuevo protocolo de iFC de impresión táctil para la evaluación detallada de los márgenes tumorales durante la extirpación de lesiones hepáticas malignas. El protocolo tiene como objetivo ofrecer información sobre los márgenes quirúrgicos después de la extirpación de tumores hepáticos malignos basada en el contenido de ADN de las células cancerosas y corroborar los resultados de iFC con los del análisis histopatológico. Basándonos en el papel establecido de iFC en otros tipos de malignidades, nuestro protocolo especializado tiene el potencial, a través de la caracterización de células en la superficie de transección hepática posthepatectomía, de ofrecer información significativa sobre el tipo de resección y la biología tumoral. Esta información se puede utilizar para guiar de manera efectiva la gestión intra y postoperatoria del paciente.