Circuitscape en Julia: Potenciando Enfoques Dinámicos para la Evaluación de la Conectividad
Autores: Hall, Kimberly R.; Anantharaman, Ranjan; Landau, Vincent A.; Clark, Melissa; Dickson, Brett G.; Jones, Aaron; Platt, Jim; Edelman, Alan; Shah, Viral B.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Circuitscape en Julia: Potenciando Enfoques Dinámicos para la Evaluación de la Conectividad
Categoría
Ciencias Medioambientales
Subcategoría
Ciencias medioambientales generales
Palabras clave
Conservación
Datos espaciales
Conectividad
Desarrollos tecnológicos
Circuitscape
Computación de alto rendimiento
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 1
Citaciones: Sin citaciones
El campo de la conservación está experimentando un rápido aumento en la cantidad, variedad y calidad de los datos espaciales que pueden ayudarnos a entender el movimiento de las especies y los patrones de conectividad del paisaje. A medida que crece el interés por representaciones más dinámicas del potencial de movimiento, los modeladores a menudo se ven limitados por la capacidad de sus herramientas analíticas para manejar estos conjuntos de datos. Los desarrollos tecnológicos en software y computación de alto rendimiento están surgiendo rápidamente en muchos campos, pero la adopción dentro de la conservación puede rezagarse, ya que nuestras herramientas o nuestra elección de lenguaje de programación pueden restringir nuestra capacidad para mantener el ritmo. Recientemente actualizamos Circuitscape, una herramienta de análisis de conectividad ampliamente utilizada, desarrollada por Brad McRae y Viral Shah, implementándola en Julia, un lenguaje de computación de alto rendimiento. En este recodificado inicial (Circuitscape 5.0) y en actualizaciones posteriores, mejoramos la eficiencia computacional y el paralelismo, logrando importantes mejoras en la velocidad y permitiendo evaluaciones en extensiones más grandes o con datos de mayor resolución. Aquí, reflexionamos sobre los beneficios para la conservación de fortalecer las colaboraciones con científicos informáticos y extraemos ejemplos de una colección de 572 aplicaciones de Circuitscape para ilustrar cómo, a través de una década de inversión repetida en el software, las aplicaciones han sido muchas, variadas y cada vez más dinámicas. Más allá de empoderar innovaciones continuas en conectividad dinámica, esperamos que los tiempos de ejecución más rápidos desempeñen un papel importante en facilitar la coproducción de evaluaciones de conectividad con las partes interesadas, aumentando la probabilidad de que la ciencia de la conectividad se incorpore en las decisiones sobre el uso del suelo.
Descripción
El campo de la conservación está experimentando un rápido aumento en la cantidad, variedad y calidad de los datos espaciales que pueden ayudarnos a entender el movimiento de las especies y los patrones de conectividad del paisaje. A medida que crece el interés por representaciones más dinámicas del potencial de movimiento, los modeladores a menudo se ven limitados por la capacidad de sus herramientas analíticas para manejar estos conjuntos de datos. Los desarrollos tecnológicos en software y computación de alto rendimiento están surgiendo rápidamente en muchos campos, pero la adopción dentro de la conservación puede rezagarse, ya que nuestras herramientas o nuestra elección de lenguaje de programación pueden restringir nuestra capacidad para mantener el ritmo. Recientemente actualizamos Circuitscape, una herramienta de análisis de conectividad ampliamente utilizada, desarrollada por Brad McRae y Viral Shah, implementándola en Julia, un lenguaje de computación de alto rendimiento. En este recodificado inicial (Circuitscape 5.0) y en actualizaciones posteriores, mejoramos la eficiencia computacional y el paralelismo, logrando importantes mejoras en la velocidad y permitiendo evaluaciones en extensiones más grandes o con datos de mayor resolución. Aquí, reflexionamos sobre los beneficios para la conservación de fortalecer las colaboraciones con científicos informáticos y extraemos ejemplos de una colección de 572 aplicaciones de Circuitscape para ilustrar cómo, a través de una década de inversión repetida en el software, las aplicaciones han sido muchas, variadas y cada vez más dinámicas. Más allá de empoderar innovaciones continuas en conectividad dinámica, esperamos que los tiempos de ejecución más rápidos desempeñen un papel importante en facilitar la coproducción de evaluaciones de conectividad con las partes interesadas, aumentando la probabilidad de que la ciencia de la conectividad se incorpore en las decisiones sobre el uso del suelo.