Análisis del genoma completo de los sitios de unión del factor de transcripción MAMSTR a través de ChIP-Seq en fibroblastos musculares esqueléticos porcinos
Autores: Li, Chenlei; Zhang, Zhe; Wei, Yilin; Qi, Kunlong; Dou, Yaqing; Song, Chenglei; Liu, Yingke; Li, Xinjian; Li, Xiuling; Wang, Kejun; Qiao, Ruimin; Yang, Feng; Han, Xuelei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis del genoma completo de los sitios de unión del factor de transcripción MAMSTR a través de ChIP-Seq en fibroblastos musculares esqueléticos porcinos
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Motivo de activación del factor de mejora de miocitos
Regulador transcripcional que contiene dominio SAP
Secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina
Regulación transcripcional
Vías metabólicas
Desarrollo de fibras musculares esqueléticas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
El motivo de activación del factor de mejora de miocitos-2 y el regulador transcripcional que contiene el dominio SAP regula su vía descendente a través de la unión en sus regiones promotoras. Sin embargo, su mecanismo molecular, particularmente los sitios de unión al ADN y los genes coreguladores, están bastante inexplorados. Por lo tanto, para identificar los sitios de unión a nivel genómico de los factores de transcripción y sus genes coreguladores, se llevó a cabo la secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina. Los resultados mostraron que estaba asociado con 1506 picos, que fueron anotados como 962 genes diferentes. La mayoría de estos genes estaban involucrados en la regulación transcripcional, vías metabólicas y desarrollo y diferenciación celular, como la vía de señalización AMPK, la vía de señalización TGF-beta, la actividad de coactivador de transcripción, la unión de coactivador de transcripción, la vía de señalización de adipocitoquinas, la digestión y absorción de grasas, el desarrollo de fibras musculares esqueléticas y la diferenciación de células musculares esqueléticas. Por último, los niveles de expresión y las actividades transcripcionales de , , , , y fueron seleccionados y verificados a través de marcadores funcionales y análisis. En general, este estudio ha aumentado nuestra comprensión del mecanismo regulador durante el desarrollo de fibroblastos musculares esqueléticos y proporcionó una referencia para analizar los mecanismos de desarrollo muscular.
Descripción
El motivo de activación del factor de mejora de miocitos-2 y el regulador transcripcional que contiene el dominio SAP regula su vía descendente a través de la unión en sus regiones promotoras. Sin embargo, su mecanismo molecular, particularmente los sitios de unión al ADN y los genes coreguladores, están bastante inexplorados. Por lo tanto, para identificar los sitios de unión a nivel genómico de los factores de transcripción y sus genes coreguladores, se llevó a cabo la secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina. Los resultados mostraron que estaba asociado con 1506 picos, que fueron anotados como 962 genes diferentes. La mayoría de estos genes estaban involucrados en la regulación transcripcional, vías metabólicas y desarrollo y diferenciación celular, como la vía de señalización AMPK, la vía de señalización TGF-beta, la actividad de coactivador de transcripción, la unión de coactivador de transcripción, la vía de señalización de adipocitoquinas, la digestión y absorción de grasas, el desarrollo de fibras musculares esqueléticas y la diferenciación de células musculares esqueléticas. Por último, los niveles de expresión y las actividades transcripcionales de , , , , y fueron seleccionados y verificados a través de marcadores funcionales y análisis. En general, este estudio ha aumentado nuestra comprensión del mecanismo regulador durante el desarrollo de fibroblastos musculares esqueléticos y proporcionó una referencia para analizar los mecanismos de desarrollo muscular.