Entre los factores ambientales que afectan la nidificación de las aves en cajas nido, la influencia de las comunidades microbianas se comprende relativamente poco. En este estudio, se muestrearon cajas nido utilizadas para la cría por nidos secundarios antes del inicio de la temporada de cría para evaluar las cargas bacterianas de la caja nido en relación con su estado del año anterior. Diferentes partes de la caja nido de madera ofrecen condiciones variables para el desarrollo de bacterias. Durante la temporada de cría, el agujero de entrada de la caja nido es limpiado por las aves, transfiriendo bacterias a sus cuerpos, pero durante el invierno, está expuesto a condiciones externas desfavorables. El interior de la caja nido, a su vez, también es limpiado por las aves, pero las condiciones durante el invierno son más estables allí. Por lo tanto, se tomaron muestras del agujero de entrada y del interior de la caja nido en dos sitios de estudio diferentes: un parque urbano y un bosque natural. Predijimos que tanto la ocupación de las cajas nido durante la temporada de cría anterior por las aves como los sitios de nidificación influirían en la carga bacteriana de la caja nido. Para verificar esta predicción, se muestrearon dos categorías de cajas nido en ambos sitios de estudio: cajas nido ocupadas por cualquiera de las dos especies de carboneros (Carbonero común o Carbonero azul) en la temporada anterior para la cría y cajas nido que habían permanecido vacías ese año. La carga bacteriana interior de la caja nido fue mayor en las cajas nido ocupadas en la temporada de cría anterior, pero solo en el área forestal. Además, la carga bacteriana tanto del agujero de entrada de la caja nido como del interior fue significativamente mayor en el área de estudio forestal en ambas cajas nido ocupadas y desocupadas. Nuestros resultados muestran que la carga bacteriana de la caja nido está relacionada positivamente con la presencia de nidos en la temporada de cría anterior y puede variar entre diferentes sitios.