Las necropsias pueden revelar problemas en los rebaños o comorbilidades que pueden llevar a correcciones en la gestión, mejoras en el rendimiento animal y una mejor toma de decisiones. Además, el patrón y las causas de mortalidad pueden diferir cuando se evalúan diferentes sistemas. El presente estudio se llevó a cabo para establecer las principales causas de muerte en lechones de cría de diferentes sistemas en Brasil, así como los aspectos clínicos, microbiológicos y patológicos de estas mortalidades. Se analizaron dieciocho criaderos (un total de 120,243 lechones alojados) y se realizaron 557 necropsias. La infección fue la causa de muerte más prevalente (21.2%), seguida de la poliserositis bacteriana (16.7%), enteritis atrófica crónica (13.5%), salmonelosis (8.8%), neumonía (8.6%) y colibacilosis (6.1%). El aumento en la tasa de mortalidad en criaderos individuales y, en consecuencia, en los diagnósticos, se asoció comúnmente con brotes de enfermedades. Las enfermedades infecciosas constituyeron la mayor parte de los diagnósticos, lo que representa una gran oportunidad para mejorar las tasas de producción en los rebaños. Además, la amplia gama de diagnósticos observados resalta la importancia de realizar investigaciones diagnósticas preliminares basadas en necropsias para determinar las causas de muerte. Este enfoque permite dirigir pruebas complementarias, que pueden diagnosticar agentes con mayor especificidad. Como resultado, esto permite la implementación de estrategias de prevención y control más efectivas.