El síndrome de ovario poliquístico (SOP) es un trastorno multifactorial asociado con la infertilidad femenina. Nuestro objetivo fue investigar los efectos de la L-carnitina y la acetil-L-carnitina. Se administró dehidroepiandrosterona a ratones CD1, solos o con L-carnitina y acetil-L-carnitina. Las trompas de Falopio fueron sometidas a histología e inmunohistoquímica para evaluar su morfología, deposición de colágeno y esteroidogénesis. También se investigaron daños oxidativos, mitocondriales y dependientes de metilglioxal. A través de microscopía electrónica de transmisión, evaluamos las alteraciones ultraestructurales. Las trompas de Falopio en el SOP se vieron afectadas por hiperfibrosis, hiperplasia, hipertrofia y esteroidogénesis alterada, con modificaciones oxidativas; se encontró una cobertura ciliar reducida y numerosos espacios intercelulares dilatados en el epitelio. La suplementación oral de carnitinas mejoró las alteraciones morfológicas observadas en las trompas de Falopio del SOP, con una atenuación del estrés oxidativo y glicativo.