La identificación de alteraciones transcriptómicas del carcinoma ductal in situ (DCIS) HER2+ que están asociadas con la densidad de linfocitos infiltrantes de tumores (TILs) podría contribuir a optimizar las decisiones sobre el potencial beneficio de la terapia inmune. Comparamos el perfil de expresión génica de DCIS HER2+ con escasos TILs con el de DCIS HER2+ con abundantes TILs. Se microdisectaron células tumorales de 11 casos de DCIS con abundantes TILs y 12 casos de DCIS con escasos TILs para la aislamiento de ARN. Se utilizó el Kit de Expresión Génica del Transcriptoma Humano Ion AmpliSeq para la secuenciación de ARN. Después de la normalización, se utilizó una prueba de suma de rangos de Mann-Whitney para analizar los genes expresados diferencialmente entre DCIS HER2+ con escasos TILs y DCIS HER2+ con abundantes TILs. Se realizaron secciones de tejido completo con inmunotinción para validar la expresión de proteínas. Identificamos un perfil de expresión génica de 29 genes que diferenciaba DCIS HER2+ con abundantes TILs de DCIS HER2+ con escasos TILs. Estos genes incluían , y , que fueron descritos previamente en cáncer de mama e inmunidad contra el cáncer y se expresaron más en DCIS con abundantes TILs. Usando inmunohistoquímica, encontramos una menor expresión de proteínas en DCIS con abundantes TILs. Esto sugiere una regulación de la expresión de proteínas a nivel post-traduccional. Identificamos un perfil de expresión génica de células de DCIS HER2+ que estaba asociado con la densidad de TILs. Este clasificador puede guiar hacia decisiones más racionalizadas respecto a la terapia mediada por el sistema inmune en DCIS HER2+, como la terapia de vacunas dirigidas.