La quinua es un alimento saludable que posee altos niveles de proteína enriquecida con aminoácidos esenciales para la dieta. La cosecha es altamente diversa y está bien adaptada a las condiciones climáticas cambiantes. A pesar de ser vulnerable a plagas y enfermedades, el desarrollo de nuevas variedades resistentes es posible. Aprovechar esta variabilidad genética es crucial para los programas de cría, especialmente para adaptar la quinua a las cambiantes necesidades de los productores. En este estudio, se caracterizaron y evaluaron agronómicamente 25 accesiones peruanas y dos variedades comerciales en el desierto del Pacífico peruano. Se utilizaron metodologías y descriptores específicos de los cultivos existentes, analizando un total de 24 variables cuantitativas y 23 cualitativas con 15 repeticiones por acceso. Los datos fueron procesados utilizando estadísticas descriptivas y un análisis multivariado. Los resultados mostraron una alta variabilidad en las características morfológicas, con un área bajo la curva de progreso de la enfermedad (AUDPC) de la presencia de mildiu entre 529 y 1725, destacando ACC06 con una menor gravedad de mildiu. El porcentaje de saponinas varió entre 0.04 y 0.21 por ciento, siendo ACC06 el de menor porcentaje. En cuanto al rendimiento del cultivo, osciló entre 0.35 y 8.80 t ha, destacando las accesiones de alto rendimiento ACC55 y ACC14. Estos resultados fueron prometedores para la mejora del rendimiento de la quinua en las condiciones de producción del desierto del Pacífico peruano.