Caracterización y análisis de expresión de la familia de genes en arroz (L.)
Autores: Luo, Xi; Wang, Hongfei; Wei, Yidong; Wu, Fangxi; Zhu, Yongsheng; Xie, Hongguang; Xie, Huaan; Zhang, Jianfu
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Caracterización y análisis de expresión de la familia de genes en arroz (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Proteínas
Factores de transcripción
Desarrollo
Familia ALOG
Arroz
Patrones de expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
Las proteínas ALOG (LSH1 y G1) constituyen una familia específica de plantas de factores de transcripción que desempeñan roles cruciales en el desarrollo de órganos laterales en las plantas terrestres. Inicialmente identificados a través de estudios genéticos en Arabidopsis LSH1 y las proteínas G1 de arroz, los miembros de la familia ALOG han sido caracterizados funcionalmente en varias especies de plantas. Sin embargo, la investigación centrada en las características y patrones de expresión de todos los miembros de la familia en arroz sigue siendo relativamente limitada. En este estudio, caracterizamos sistemáticamente los genes de la familia en arroz. En comparación con otros genes en arroz, los genes de la familia ALOG tienen una estructura relativamente simple. La alineación de las secuencias de aminoácidos de OsALOG y el análisis de predicciones de desorden revelan que todos los miembros poseen dominios ALOG conservados, mientras que la conservación de las regiones intrínsecamente desordenadas (IDRs) es relativamente baja. Cuatro aminoácidos: alanina, glicina, prolina y serina, están significativamente enriquecidos en las IDRs de cada proteína ALOG. El análisis de sinonimia indica que la mayoría de los genes han experimentado una divergencia considerable en comparación con sus contrapartes. El análisis bioinformático de elementos reguladores predice que los genes de la familia contienen elementos sensibles a ABA, luz y jasmonato de metilo, aunque la abundancia y composición de estos elementos varían entre los diferentes miembros. Los patrones de expresión asociados con el desarrollo floral del arroz de los genes se pueden clasificar en dos tipos; sin embargo, incluso dentro del mismo tipo, se observaron diferencias en los niveles de expresión, así como en el tiempo de inicio y la duración de la expresión. Estos resultados proporcionan una comprensión integral de las características estructurales y los patrones de expresión de los miembros en arroz.
Descripción
Las proteínas ALOG (LSH1 y G1) constituyen una familia específica de plantas de factores de transcripción que desempeñan roles cruciales en el desarrollo de órganos laterales en las plantas terrestres. Inicialmente identificados a través de estudios genéticos en Arabidopsis LSH1 y las proteínas G1 de arroz, los miembros de la familia ALOG han sido caracterizados funcionalmente en varias especies de plantas. Sin embargo, la investigación centrada en las características y patrones de expresión de todos los miembros de la familia en arroz sigue siendo relativamente limitada. En este estudio, caracterizamos sistemáticamente los genes de la familia en arroz. En comparación con otros genes en arroz, los genes de la familia ALOG tienen una estructura relativamente simple. La alineación de las secuencias de aminoácidos de OsALOG y el análisis de predicciones de desorden revelan que todos los miembros poseen dominios ALOG conservados, mientras que la conservación de las regiones intrínsecamente desordenadas (IDRs) es relativamente baja. Cuatro aminoácidos: alanina, glicina, prolina y serina, están significativamente enriquecidos en las IDRs de cada proteína ALOG. El análisis de sinonimia indica que la mayoría de los genes han experimentado una divergencia considerable en comparación con sus contrapartes. El análisis bioinformático de elementos reguladores predice que los genes de la familia contienen elementos sensibles a ABA, luz y jasmonato de metilo, aunque la abundancia y composición de estos elementos varían entre los diferentes miembros. Los patrones de expresión asociados con el desarrollo floral del arroz de los genes se pueden clasificar en dos tipos; sin embargo, incluso dentro del mismo tipo, se observaron diferencias en los niveles de expresión, así como en el tiempo de inicio y la duración de la expresión. Estos resultados proporcionan una comprensión integral de las características estructurales y los patrones de expresión de los miembros en arroz.