Caracterización genómica y transcriptómica de durante la infección
Autores: Gai, Yunpeng; Niu, Qichen; Kong, Jinchao; Li, Lei; Liang, Xingxing; Cao, Yuwei; Zhou, Xianqi; Sun, Xuepeng; Ma, Haijie; Wang, Mingshuang; Shrivastava, Neeraj; Li, Hongye; Jiao, Chen
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Caracterización genómica y transcriptómica de durante la infección
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Interacciones huésped-patógeno
Mancha marrón de alternaria
Factores de virulencia
Transcriptoma de defensa
Expresión génica
Interacción planta-patógeno
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 35
Citaciones: Sin citaciones
Las interacciones hospedador-patógeno son el resultado de la dinámica evolutiva continua de las interfaces genómicas entre los patógenos y las plantas hospederas. La mancha marrón de Alternaria (ABS) causada por el patógeno es una seria amenaza para la producción de mandarinas. Aunque estudios recientes han logrado avances significativos en la caracterización de factores de virulencia, existe una brecha en la regulación de genes virulentos a lo largo del curso de la infección en las plantas hospederas. Para obtener una mejor comprensión del transcriptoma de defensa dinámica durante la infección, realizamos un enfoque transcriptómico comparativo. Después de la inoculación en cítricos, encontramos que 2142, 1964, 2359 genes fueron sobreexpresados, y 1948, 1434, 1996 genes fueron subexpresados a las 12 horas post-inoculación (hpi), 24 hpi y 48 hpi, respectivamente. Entre estos genes, 1333 genes fueron sobreexpresados en los tres puntos de tiempo, y 1054 genes fueron subexpresados, lo que indica que la mayoría de los genes diferencialmente expresados en la etapa temprana de la infección tendían a permanecer diferencialmente expresados en la etapa posterior de la infección. Además de los genes que se sabe que forman parte de la red de infección en las interacciones planta-patógeno, se identificaron muchos genes novedosos relacionados con la interacción planta-patógeno. Interesantemente, nuestros resultados indican que el patógeno es capaz de alterar rápidamente su patrón de expresión génica durante el proceso de infección, lo cual es vital para la exitosa colonización del patógeno. Además, esta rápida alteración de la expresión génica probablemente sea un mecanismo adaptativo, que permite al patógeno responder rápidamente a cualquier cambio en el entorno y adaptarse al sistema de defensa del hospedador. Esta capacidad de modificar rápidamente la expresión génica frente a cambios ambientales podría desempeñar un papel crítico en el establecimiento exitoso de la infección. El análisis de RT-qPCR confirmó que el patrón de expresión de nueve genes seleccionados al azar de la vía del peroxisoma fue consistente con los datos de RNA-seq. Nuestro estudio proporcionó un estudio integral de la expresión de genes durante la infección de cítricos, lo cual puede facilitar la comprensión de las interacciones hospedador-planta en .
Descripción
Las interacciones hospedador-patógeno son el resultado de la dinámica evolutiva continua de las interfaces genómicas entre los patógenos y las plantas hospederas. La mancha marrón de Alternaria (ABS) causada por el patógeno es una seria amenaza para la producción de mandarinas. Aunque estudios recientes han logrado avances significativos en la caracterización de factores de virulencia, existe una brecha en la regulación de genes virulentos a lo largo del curso de la infección en las plantas hospederas. Para obtener una mejor comprensión del transcriptoma de defensa dinámica durante la infección, realizamos un enfoque transcriptómico comparativo. Después de la inoculación en cítricos, encontramos que 2142, 1964, 2359 genes fueron sobreexpresados, y 1948, 1434, 1996 genes fueron subexpresados a las 12 horas post-inoculación (hpi), 24 hpi y 48 hpi, respectivamente. Entre estos genes, 1333 genes fueron sobreexpresados en los tres puntos de tiempo, y 1054 genes fueron subexpresados, lo que indica que la mayoría de los genes diferencialmente expresados en la etapa temprana de la infección tendían a permanecer diferencialmente expresados en la etapa posterior de la infección. Además de los genes que se sabe que forman parte de la red de infección en las interacciones planta-patógeno, se identificaron muchos genes novedosos relacionados con la interacción planta-patógeno. Interesantemente, nuestros resultados indican que el patógeno es capaz de alterar rápidamente su patrón de expresión génica durante el proceso de infección, lo cual es vital para la exitosa colonización del patógeno. Además, esta rápida alteración de la expresión génica probablemente sea un mecanismo adaptativo, que permite al patógeno responder rápidamente a cualquier cambio en el entorno y adaptarse al sistema de defensa del hospedador. Esta capacidad de modificar rápidamente la expresión génica frente a cambios ambientales podría desempeñar un papel crítico en el establecimiento exitoso de la infección. El análisis de RT-qPCR confirmó que el patrón de expresión de nueve genes seleccionados al azar de la vía del peroxisoma fue consistente con los datos de RNA-seq. Nuestro estudio proporcionó un estudio integral de la expresión de genes durante la infección de cítricos, lo cual puede facilitar la comprensión de las interacciones hospedador-planta en .