Caracterización a Nivel del Genoma de los Genes de Gliceraldehído-3-Fosfato Deshidrogenasa y Su Perfil de Expresión Bajo Estrés por Sequía en
Autores: Lim, Hyemin; Denison, Michael Immanuel Jesse; Lee, Kyungmi; Natarajan, Sathishkumar; Kim, Tae-Lim; Oh, Changyoung
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Caracterización a Nivel del Genoma de los Genes de Gliceraldehído-3-Fosfato Deshidrogenasa y Su Perfil de Expresión Bajo Estrés por Sequía en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Glicerol-3-fosfato deshidrogenasa
GAPDH
Vía de la glucólisis
Estrés abiótico
Familia de genes
Estrés por sequía
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 13
Citaciones: Sin citaciones
La gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa (GAPDH) es crucial en el metabolismo de las plantas y en las respuestas a diversos estreses abióticos. En la vía de la glucólisis, el gliceraldehído-3-fosfato (G3P) se oxida a 1,3-bisfosfoglicerato (1,3-BPG) a través de la acción catalítica de GAPDH. Sin embargo, la familia de genes en ha sido mínimamente investigada. En este estudio, identificamos 13 genes que codifican GAPDH a través de un análisis bioinformático de datos genómicos. Los estudios evolutivos sugieren que estos genes están estrechamente relacionados con los de y . Realizamos un estudio integral del genoma completo, que incluyó predicciones de localización subcelular, análisis de la estructura del gen, identificación de motivos proteicos, colocación cromosómica y análisis de regiones reguladoras. También examinamos la expresión de las proteínas y genes de GAPDH en varios tejidos de y bajo estrés por sequía. Los resultados indicaron patrones de expresión diversos en diferentes tejidos y expresión diferencial en condiciones de sequía. Notablemente, la expresión de Qurub.02G290300.1, Qurub.10G209800.1 y Qrub.M241600.1 aumentó significativamente en los tejidos de hoja, tallo y raíz bajo estrés por sequía. Este estudio proporciona un análisis sistemático de los genes, sugiriendo sus roles fundamentales en la respuesta al estrés por sequía de los árboles.
Descripción
La gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa (GAPDH) es crucial en el metabolismo de las plantas y en las respuestas a diversos estreses abióticos. En la vía de la glucólisis, el gliceraldehído-3-fosfato (G3P) se oxida a 1,3-bisfosfoglicerato (1,3-BPG) a través de la acción catalítica de GAPDH. Sin embargo, la familia de genes en ha sido mínimamente investigada. En este estudio, identificamos 13 genes que codifican GAPDH a través de un análisis bioinformático de datos genómicos. Los estudios evolutivos sugieren que estos genes están estrechamente relacionados con los de y . Realizamos un estudio integral del genoma completo, que incluyó predicciones de localización subcelular, análisis de la estructura del gen, identificación de motivos proteicos, colocación cromosómica y análisis de regiones reguladoras. También examinamos la expresión de las proteínas y genes de GAPDH en varios tejidos de y bajo estrés por sequía. Los resultados indicaron patrones de expresión diversos en diferentes tejidos y expresión diferencial en condiciones de sequía. Notablemente, la expresión de Qurub.02G290300.1, Qurub.10G209800.1 y Qrub.M241600.1 aumentó significativamente en los tejidos de hoja, tallo y raíz bajo estrés por sequía. Este estudio proporciona un análisis sistemático de los genes, sugiriendo sus roles fundamentales en la respuesta al estrés por sequía de los árboles.