La diversidad genética, morfológica y taxonómica del género se debe a la hibridación homoploide y poliploide, la autoploidia y la apomixis, que también influyen en la producción y diversidad de metabolitos secundarios, especialmente flavonoides. El objetivo de este estudio fue investigar las relaciones y variaciones de los flavonoides en términos de origen híbrido y nivel de ploidía entre las especies parentales y sus derivados híbridos. El diseño de muestreo incluyó material foliar de los siguientes accesos de diez localidades naturales: taxones parentales (di-, tri- y tetraploides de; diploide y) y sus derivados híbridos di-, tri- y tetraploides de cruces de x (subg.) así como el tetraploide y, que se originan de cruces de x (subg.). Analizamos los perfiles de flavonoides de las fracciones foliares mediante LC-MS. Se identificaron un total de 23 flavonoides, incluidos derivados de apigenina y luteolina, que distinguen los grupos híbridos entre sí. Este perfil destaca la distintividad de los accesos y enfatiza el potencial del subg. para futuras investigaciones sobre compuestos bioactivos en estudios biológicos.